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Nat Methods | 田鲁亦/刘晓东团队系统性评估11种空间组学技术

通过评估,不同技术方案各有优劣,并且一些国产的技术平台的指标已经达到领先,凸显了中国在这一新兴领域的快速发展趋势。

2024-07-15

Cell:开发出一种称为 Open-ST 的空间转录组学平台,能够三维重建组织内细胞中的基因表达

Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法,可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐,可将组织重建为三维“虚拟组织块”。

2024-07-24

Nature Genetics | 揭示肺纤维化新视界:从小鼠到人的空间转录组学描绘特发性肺纤维化(IPF)病理机制

该研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,详细描绘了IPF和小鼠肺纤维化模型中的细胞相互作用和信号传导途径,揭示了关键的趋同和分歧路径。

2024-07-24

Cell重磅:章冰/高强团队等利用泛癌蛋白基因组学分析,绘制癌症治疗靶点全景图

临床蛋白质组肿瘤分析联盟(CPTAC)对1000多个前瞻性收集的、未经治疗的原发肿瘤进行了蛋白质组学和基因组学特征分析,涵盖了10种癌症类型,其中许多肿瘤还配有相应的正常组织样本。

2024-06-25

科研团队发布黄瓜近完整参考基因组及多组学综合数据库

该研究搭建了第一个黄瓜多组学数据库Cucumber-DB(http://www.cucumberdb.com/),囊括了重要的黄瓜泛基因组、核心种质变异组和转录组数据。

2024-06-25

二球悬铃木古六倍体基因组进化及开花调节方面取得重要进展

研究结果表明二球悬铃木开花时间基因的拷贝数增加及随后的亚功能化/新功能化可能为二球悬铃木独特的开花特征提供了遗传基础。

2024-06-10

Cell:利用Perturb-seq技术大规模探究与关键发育基因相关的脑细胞类型

研究人员发明了一种名为体内Perturb-seq的新技术。这种方法利用CRISPR-Cas9技术和单细胞转录组分析,一次一个细胞地测量对细胞的影响。

2024-05-26

Genome Biol:新研究构建出单细胞多组学人类细胞百科全书

这种新的单细胞图谱(SCA)是基于对来自125种不同成人和胎儿组织的数千份人体组织样本的分析。

2024-05-20

多篇文章解读科学家们在空间多组学研究领域取得的新进展!

革命性算法BANKSY或能重塑空间组学数据分析、单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得重大进展、综述文章揭示单细胞和空间组学技术在肝脏研究领域的重要进展

2024-04-27

2024年4月Cell期刊精华

科学家打造“混血大脑”,小鼠用大鼠嗅觉探索世界、人类肠道菌群中的隐性质粒有望成为识别水体粪便污染、炎症性肠病等健康问题的强大生物标志物

2024-04-29