Nature Biotechnolog：绘制剪接调控的“GPS”！KATMAP如何精准区分剪接调控的直接与间接效应？
KATMAP的诞生，不仅仅是为我们提供了一个分析数据的新工具，它更代表了一种从海量转录组数据中萃取生物学智慧的新范式。
2025-11-09
Nature Biotechnology：绘制剪接调控的“GPS”——KATMAP如何精准区分剪接调控的直接与间接效应？
KATMAP是一种全新的可解释性回归模型，能够仅凭剪接因子敲低后的RNA-seq数据和该因子的结合序列偏好 (binding motif)，就能精准推断出其活性、调控靶点，并清晰地区分直接与间接效应。
2025-11-08
Cell子刊：转录因子的"染色质画笔"，复旦大学陈飞等利用转录因子的"染色质画笔"：
该研究建立 配对的患者来源的类器官，用于研究乳腺癌如何从原发肿瘤演变为转移肿瘤。该研究揭示了驱动肿瘤进展的基于染色质的调节状态，并揭示了促进转移扩散的转录因子，为癌症演变和潜在的治疗漏洞提供了新的见。
2026-03-23
Nature Genetics：变“在场”为“在岗”——基于剪接修复的活性筛选系统，重塑高分辨率碱基编辑扫描新范式
研究团队开发了一种基于“编辑活性”的共筛选方法，它如同一枚精准的“试金石”，能够特异性地富集那些编辑真正“在岗工作”的细胞，从而将筛选的信噪比提升到了一个全新的水平。
2025-10-21
Cell Systems：开发出免疫细胞重编程的组合转录因子筛选平台
研究创建了一个包含超过400个免疫相关因子的文库，每个因子都用一个独特的DNA条形码标记。利用这个系统，他们能够同时测试数千种组合，并追踪哪些组合触发了向特定免疫细胞的转化。
2026-02-13
Nature Genetics：陈万泽团队开发单细胞转录因子测序技术，剖析转录因子剂量对细胞重编程异质性的影响
该研究开发了 scTF-seq技术，实现了剂量敏感的大规模基因扰动单细胞组学，并以转录因子介导的细胞重编程为模型，系统揭示了基因剂量在细胞命运调控中未被充分认识的多层次、非线性复杂效应。
2025-10-06
