Cell：开发出一种称为 Open-ST 的空间转录组学平台，能够三维重建组织内细胞中的基因表达
Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法，可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐，可将组织重建为三维“虚拟组织块”。
2024-07-15
Nature Genetics | 揭示肺纤维化新视界：从小鼠到人的空间转录组学描绘特发性肺纤维化（IPF）病理机制
该研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术，详细描绘了IPF和小鼠肺纤维化模型中的细胞相互作用和信号传导途径，揭示了关键的趋同和分歧路径。
2024-07-04
Science：科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型
研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序，当分析了数以万计已知的人类启动子数据后，这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成，即基序、启动子和三核苷酸（trinucleotides）。
2024-05-27
研究揭示增强子-启动子通讯调控转录爆发的基本原理
近日，中山大学数学学院张家军教授团队开发了一个通用的理论框架，该框架整合了快时间尺度上的染色质空间运动和慢时间尺度上的基因转录爆发过程。
2024-03-16
计算机模拟+创新的体外实验模型！APL Bioeng：耶鲁大学科研团队运用先进模拟技术，揭秘乳腺癌细胞侵袭脂肪组织之谜
研究团队证实，癌细胞的活跃度与黏性、脂肪细胞的硬度以及ECM的约束力，共同决定了癌细胞是否能够成功侵入脂肪组织，以及侵入后的表现形式。
2024-08-22
单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测，并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析，具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Science：细菌利用一种逆转录酶将非编码 RNA转化为新的基因，有效抑制病毒复制
Sternberg与Tang所研究的细菌防御系统显得异常独特：它涉及到一种未知功能的RNA片段以及一种逆转录酶——一种能够以RNA为模板合成DNA的酶。
2024-08-19