Science：科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型
研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序，当分析了数以万计已知的人类启动子数据后，这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成，即基序、启动子和三核苷酸（trinucleotides）。
2024-05-27
研究揭示内源性逆转录病毒调控人类胎盘发育与疾病的新机制
本研究丰富了HERVH 调控早期胚胎发育的多重角色，揭示了内源性逆转录病毒促进胎盘滋养层谱系发育的新机制，并为研究胎盘发育性疾病提供了新的视角和思路。
2024-04-21
研究鉴定出小麦穗发育的转录调控因子
为促进小麦穗发育研究和分子设计育种，团队与合作者搭建了小麦穗发育多组学数据库，提供了包括基因信息查询、共表达分析、TRN预测、表观图谱绘制及突变体库检索等模块在内的“一站式”服务。
2024-02-12
研究揭示增强子-启动子通讯调控转录爆发的基本原理
近日，中山大学数学学院张家军教授团队开发了一个通用的理论框架，该框架整合了快时间尺度上的染色质空间运动和慢时间尺度上的基因转录爆发过程。
2024-03-16
Nature子刊：浙江大学孙会增/王永成团队开发微生物组单细胞转录组学技术，揭示奶牛瘤胃微生物活性功能类群
该研究利用MscT技术，通过基于BGMGM的泛基因组功能基因比对策略，揭示了瘤胃微生物生态系统原位活性代谢功能类群。
2024-06-16
单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测，并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析，具有广泛的应用场景。
2024-02-21
李程/孙育杰/黄粤团队揭示异倍体对染色质空间结构和转录组的影响
本研究结合Hi-C、RNA-seq、染色体成像和新生RNA成像技术，探究了异倍体ESC相比正常二倍体ESC在染色质三维结构和基因转录层面的变化。
2024-04-12