Nature：中外科学家联手揭示结直肠癌的预后基因组和转录组特征

结直肠癌是第三大常见肿瘤，也是第二大致命肿瘤。这种疾病是由癌症驱动基因突变导致细胞生长失控引起的。

在一项新的研究中，来自中国华大基因研究院、瑞典乌普萨拉大学、卡罗林斯卡医学院和于默奥大学的研究人员利用独特的结直肠癌遗传数据集和临床数据集，揭示了新的基因改变，并开发出一种新的肿瘤变异分子分类器。这一发现可能为个体化治疗提供更多可能性。相关研究结果于2024年8月7日在线发表在Nature期刊上，论文标题为“Prognostic genome and transcriptome signatures in colorectal cancers”。论文通讯作者为华大基因研究院的Cong Lin和Kui Wu以及乌普萨拉大学的Tobias Sjöblom和Bengt Glimelius。

为了了解这些基因改变与疾病发展和预后之间的联系，研究者对来自1000多名结直肠癌患者的肿瘤和正常组织的DNA进行了测序。

Sjöblom说，“由于我们还获得了这些患者的临床信息，因此我们的研究产生了世界上最大的结直肠癌队列之一，其中包含全面的临床数据和基因组数据。这个数据集的范围是开创性的，为该领域的科学家们提供了大量信息。”

在这篇首次发表的研究论文中，研究者发现了将近100个发生突变的癌症驱动基因。其中，9 个是结直肠癌中的新型基因，24 个是任何癌症的新型基因。研究者还研究了存在哪些类型的基因改变，包括较小的突变和较大的结构变异，以及影响基因活性的基因改变。

论文共同第一作者、乌普萨拉大学的Luis Nunes说，“然后，我们将获得的遗传信息与临床信息，尤其是生存数据进行了比较：通过这种方法，我们确定了特定患者群体中关键的预后基因组改变。其中一些发现证实了之前的研究，而另一些发现则是新发现。”

图片来自Nature, 2024, doi:10.1038/s41586-024-07769-3

研究者还利用这项研究的结果，开发出了一种对结直肠癌进行分子分类的新策略。Nunes 说，“我们的分类器是基于基因活性的，有了它，我们就能有效地将大多数结直肠癌分为具有明显分子特征的五种预后亚型。这完善和补充了以前的结直肠癌亚型分类器，为不同组别的肿瘤提供了更清晰的预后图谱。”

研究者认为，他们发现的预后突变和新的肿瘤分子亚型对于未来的结直肠癌基因研究以及创新诊断和治疗策略的开发都非常重要。

Sjöblom 说，“我们的研究标志着我们在抗击结直肠癌的道路上迈出了重要一步。我们希望它能让我们更接近精准医疗，提供更有效的治疗方法，改善患者的预后。” （生物谷Bioon.com）

参考资料：

Luís Nunes et al. Prognostic genome and transcriptome signatures in colorectal cancers. Nature, 2024, doi:10.1038/s41586-024-07769-3.