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综述:实体瘤空间转录组分析的新见解

空间和时间动力学与细胞生命周期的所有特性密切相关,包括细胞发生、分化、功能和死亡。

2023-10-26

单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

科研人员开发uCoTargetX技术实现单细胞多组蛋白修饰与转录并行检测

研究者在此基础上进一步优化革新,发展了uCoTargetX技术,在国际上率先实现单细胞多种组蛋白修饰和转录组的并行检测,为深入研究各种生理病理状态下细胞命运的表观调控提供了强有力的技术工具。

2024-01-16

Nature Methods | GPT-4在单细胞分析中的突破:高效的细胞类型识别

该研究不仅证实了GPT-4在生物医学领域的应用潜力,同时也为单细胞RNA测序分析中的细胞类型标注提供了一种新的、高效的解决方案。

2024-04-06

同期两篇Cell论文,类器官+单细胞分析,揭示这种人类健康细胞实际是癌症“卧底”

这篇论文的第一作者 Maria Ramos Zapatero 博士表示,我们在这些结直肠癌中观察到的缓慢生长状态非常不寻常,通常只在胎儿发育或肠组织损伤后才会出现。

2023-12-12

EMBO Reports丨钟国华团队揭示果蝇卵巢生殖干细胞单细胞转录特征及eggplant调节分化发育潜在机制

果蝇卵巢生殖干细胞(germline stem cell,简称GSC)是干细胞生物学研究的理想模型【1】,其增殖与分化受细胞内在调控因子和微环境信号共同作用。许多参与调控GSC的内源基因与哺乳动物干细

2023-08-24

BIO Integra:单细胞RNA测序分析揭示了不同的人类自身免疫性疾病中免疫细胞的异质性

来自中国中山大学等机构的科学家们通过研究成功整合了五种不同的自身免疫性疾病中的外周血细胞的scRNA-seq数据。

2023-09-25

Nat Biotechnol | 北京大学伊成器等团队合作开发同时对5mC和5hmC进行单细胞分析的新方法

该研究提出SIMPLE-seq(通过测序同时分析表观遗传胞嘧啶修饰),用于在单细胞和单碱基分辨率下联合分析5mC和5hmC。

2024-02-14

Nat Methods | 单细胞三维基因组与基因表达联合分析:北京大学谢晓亮等团队揭示嗅觉受体选择的动态过程

该研究结果揭示了一个值得注意的模式:在OSN发展过程中,OR增强子的可及性降低,表明只有一部分增强子在成熟的OSN中保持活性。

2024-04-17

单细胞转录组测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式

这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角

2023-05-17