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细胞》亮点:庄小威联合团队看清染色质转录动态;单细胞测序揭示肺癌难根治原因

 顶尖学术期刊《细胞》在线发表了多篇论文。第一篇论文来自哈佛大学庄小威教授与Bogdan Bintu教授的联合团队。科学家们开发了一种全基因组范围内的成像技术,能够看清染色质的3D结构与转录活性。研究人员们在摘要中指出,染色质的3D结构调控了许多基因组的功能。如果有一款工具能够看清染色质的3D结构,无疑将帮助我们更好地理解其生理功能。为此,研究人员

2020-08-22

Nature Communications:研究发表单细胞转录组数据检索新方法和参考数据库

 作为细胞异质性研究的重要工具,单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展,并积累了大量研究数据。若能有效利用现有的单细胞数据进行检索与推断,研究者便能更好地进行新测序单细胞的注释,以及综合多数据集的研究。然而,精确的单细胞转录组数据检索和注释需要克服两个挑战:一、数据集之间的批次效应(batch effect)会显着影响细胞检索的可靠性;二、目前缺少跨物

2020-07-15

bioRixv:单细胞分析和机器学习确定了COVID-19的主要靶点

2020年6月6日讯 /生物谷BIOON /——耶鲁大学医学院的科学家们正在利用单细胞RNA测序来研究SARS-CoV-2如何与宿主细胞相互作用。心血管医学和计算机科学部医学助理教授David van Dijk博士和实验室医学和免疫生物学助理教授Craig Wilen博士利用被感染的人类支气管上皮细胞(HBECs)的单细胞RNA序列数据来确定病毒如何感染和改

2020-06-06

Nat Biotechnol:科学家发现能准确高效进行单细胞转录组特性分析的最佳技术—Quartz-seq2

2020年4月9日 讯 /生物谷BIOON/ --为了确保单细胞RNA测序能够使用最好的方法,日前研究人员对13种方法进行了基准性的测试,一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中,来自西班牙的科学家们通过研究发现,日本理化所开发的Quartz-seq2方法或许是进行单细胞RNA测序的最佳手段。图片来源:CC0 Public D

2020-04-09

Nat Med:超急性期HIV-1感染多细胞免疫动力学的单细胞综合分析

2020年4月10日讯 /生物谷BIOON /——细胞免疫是控制细胞内病原体的关键,但在进化的人类免疫反应中,个体细胞动力学和细胞-细胞协同性仍然知之甚少。单细胞RNA测序(scRNA-seq)是一个强有力的工具,可以用来分析健康和疾病中复杂的多细胞行为,并鉴定可测试的治疗靶点。将其应用于纵向样本可以提供一个揭示与疾病进展演变相关的细胞因子的机会,而不会潜在地混

2020-04-10

耳蜗螺旋神经节转录组分析研究获进展

 eLife 期刊在线发表了中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心/神经科学研究所、上海脑科学与类脑研究中心、神经科学国家重点实验室刘志勇研究组题为《耳蜗螺旋神经节在多个发育节点的深度转录组分析》的研究论文。小鼠和人类的听觉系统在发育和功能上十分相似。耳蜗螺旋神经节负责把外周的声音信息(时间、强度和频率等)传递到脑干的耳蜗核,随后经脑干上橄榄核团、

2020-02-18

Science:对人类血细胞中的所有蛋白编码基因进行全基因组转录组分析

2019年12月31日讯/生物谷BIOON/---在临床和研究环境中,血液都是对人类进行分子分析的主要来源,并且是许多治疗策略的目标,这突显了需要对构成人类血液的细胞进行全面的分子图谱构建。人类蛋白质图谱计划(www.proteinatlas.org)是一个开放式数据库,旨在通过整合各种组学技术(包括基于抗体的成像)来绘制所有人类蛋白的图谱。以前,人类蛋白质

2019-12-31

研究开发单细胞空间转录组数据分析可视化平台

单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息,而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相

2019-11-16

辉瑞公布ARCHER 1050研究中来自亚洲亚组分析的积极结果 接受达可替尼一线治疗的EGFR突变非小细胞肺癌患者(NSCLC)的无进展生存期和总生存期得到了显著延长

辉瑞公司(纽约证券交易所代码:PFE)今天公布了ARCHER 1050研究中亚洲患者亚组分析的疗效和耐受性结果,该研究是一项随机、国际多中心、III期、开放标签临床研究,旨在评估表皮生长因子受体(EGFR)酪氨酸激酶抑制剂(TKI)——多泽润(VIZIMPRO)®(达可替尼(dacomitinib))作为EGFR激活突变的局部晚期或转移性非小细胞肺癌(NSCLC)患者的一线单药治疗的功效

2019-11-25

Science:利用单细胞基因组学进行人类细胞表型分析

2019年10月20日讯/生物谷BIOON/---在一篇近期发表在Science期刊上的标题为“Mapping human cell phenotypes to genotypes with single-cell genomics”的综述类型文章中,瑞士研究人员认为在了解构成人体的细胞表型和人类基因组如何被用来构建和维持每个细胞的目标中,我们正处在一个迷人的旅程中。瑞士巴塞尔分子与临床眼科研究所

2019-10-20