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我国科学家首次绘制脊索动物完整单细胞转录谱系

  解析细胞命运决定过程的转录动态是发育生物学的核心问题之一,对了解发育基本规律以及干细胞分化的转化起到关键性的作用。近年来,随着单细胞基因组学的兴起,解决了细胞种类的多样性和发育过程的不确定性带来的难题,使得理解胚胎发育细胞谱系变成可能,为研究细胞命运决定提供了技术基础。近期,昆明理工大学陈凯教授牵头的国际合作团队在国际最著名期刊Nature杂志上,发表了题为“Compreh

2019-09-19

Nature:利用单细胞转录组学揭示成神经管细胞瘤不同亚型的细胞组成

2019年7月28日讯/生物谷BIOON/---成神经管细胞瘤(medulloblastoma)是一种恶性儿童小脑肿瘤类型,包含不同的分子亚型。成神经管细胞瘤已被分为四种不同的分子亚型:WNT和SHH(均由它们的同名基因发生的突变驱动),组3和组4。组3和组4占所有成神经管细胞瘤病例的60%,但是也最少被人理解的。这部分上是因为当前没有在遗传上准确地模拟组4的实验室模型。此外,尽管这些亚型的基因组

2019-07-28

Nature:首次对阿尔茨海默病进行单细胞转录组分析

2019年5月13日讯/生物谷BIOON/---在美国,阿尔茨海默病影响了500多万人。在一项新的研究中,来自美国麻省理工学院的研究人员首次对阿尔茨海默病患者的单个脑细胞中表达的基因进行了综合分析。所获得的分析结果允许他们鉴定出在神经元和其他类型的脑细胞中受到影响的独特细胞通路。这一分析可能为阿尔茨海默病提供许多潜在的新型药物靶点。相关研究结果于2019年5月1日在线发表在Nature期刊上,论文

2019-05-13

Nat Methods:开发出一种新的基因组学工具ECCITE-seq,可扩展多模式单细胞分析

2019年5月10日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自美国纽约基因组中心的研究人员开发出一种称为ECCITE-seq的新技术,它允许科学家们对来自单细胞的多种信息模式进行高通量测量。相关研究结果发表在2019年5月的Nature Methods期刊上,论文标题为“Multiplexed detection of proteins, transcriptomes, clonotype

2019-05-10

Science:我国科学家通过优化单细胞多组学测序技术分析结直肠癌异质性

2018年12月3日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自中国北京大学第三医院、北京未来基因诊断高精尖创新中心和北大-清华生命科学联合中心和的研究人员发现利用优化的单细胞多组学测序能够更好地揭示结直肠癌异质性。相关研究结果发表在2018年11月30日的Science期刊上,论文标题为“Single-cell multiomics sequencing and analyses of hu

2018-12-03

Science:利用单细胞分析揭示蝾螈再生肢体机制

2018年10月30日/生物谷BIOON/---美西螈(Ambystoma mexicanum, 也称钝口螈,六角恐龙)和其他的蝾螈是唯一能够再生全肢的四足动物。在这个复杂的过程中,基因表达的变化调节着新的附属肢体长出,但是人们对损伤如何诱导肢体细胞形成能够分化为多种细胞类型的再生性祖细胞知之甚少。在肢体再生过程中,对单个细胞进行追踪和分子分析将会鉴定出不同的分化途径,并为细胞如何从成熟的静息状态

2018-10-30

循环肿瘤细胞捕获及单细胞分析样机在大连研制成功

   由大连医科大学牵头,与中国科学院深圳先进技术研究院等多家单位合作,在国家科技计划支持下,历经三年研发,成功构建了具有自主知识产权的循环肿瘤细胞(circulating tumor cell,CTC)捕获及单细胞分析样机,显示出较好的应用前景。CTC是存在于患者外周血中的各类肿瘤细胞的统称,对其进行捕获及分选有助于肿瘤转移风险的预测和判断,可提供治疗反应及预后等重

2018-10-26

单细胞RNA性能分析新方法

  人体由130亿个细胞按不同功能、分门别类顺序组成,每个细胞都有其独特的分子“指纹”,即使是坐落于同一族群之中的细胞也可以彼此不同。并且它们的活动也会随时间变化。单细胞分析工具的应运而生就是为了解决细胞-细胞间非均质的复杂机制。正如德国慕尼黑大学(LMU)分子生物学家Wolfgang Enard教授在他们新发表的论文写道“单细胞技术对生命科学来说是一场变革,”他的课题组利用这

2018-08-27

利用sci-CAR方法同时分析上千个细胞中的转录组和染色质可接近性

2018年9月6日/生物谷BIOON/---不同细胞类型的基因组可能是相同的,但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成,而转录组指的是在某一特定条件下,细胞内所有转录产物的集合。转录产物经翻译后会产生蛋白。在RNA转录过程中,细胞仅能够接近它们的染色质包装的双链基因组的某些部分。鉴于这种接近在不同细胞类型之间存在着变化,因此染色质可接近性有

2018-09-06

NYGC研究人员创建用于单细胞分析的低成本开源3D打印设备

  3D打印的许多优点使得各行业在发展中取得创新性进展。尽管研究人员和制造商对操纵3D领域进行生物打印、创建实验室和医疗设备等等更感兴趣,但医学领域正在取得一些最不可否认的重大影响。随着研究人员不断深入研究,他们在提高全球患者的生活质量方面取得更大成功,其中包括使用微流控装置。NYGC研究人员创建用于单细胞分析的低成本开源3D打印设备NYGC研究人员创建用于单细胞分析的低成本开

2018-07-24