清华大学生命学院杨雪瑞课题组开发深度学习工具DeepLinc，使用单细胞空间转录组数据构建细胞互作网络
DeepLinc针对单细胞空间转录组数据，提出新的方法理论，通过新型深度学习模型的创新应用，挖掘细胞分子特征谱图与复杂生理与病理组织之间的多层级复杂关联，充分释放单细胞空间组学分析的优势与潜力。
2022-06-13
Science：对癌症中体细胞非编码突变模式的全基因组分析
肿瘤产生的一个关键标志是癌细胞在其基因组中获得了正常组织中不存在的体细胞突变。一些突变是驱动突变（driver mutation），有助于肿瘤细胞生长，但其他许多突变是乘客突变（passenger m
2022-04-13
Cell Reports小鼠胚胎早期内耳神经节单细胞转录组及其发育轨迹特征分析研究获进展
Cell Reports在线发表了题为Single-cell transcriptomic landscapes of the otic neuronal lineage at multiple early embryonic ages的研究论文，该研究由中国科学院脑科学与智能技术卓越创新中心（神经科学研究所）、神经科学国家重点实验室、上海脑科学与类脑研究中
2022-03-28
Nucleic Acids Research：同济大学王晨飞团队开发空间转录组分析算法——STRIDE
近些年，高通量单细胞测序技术的发展，使得研究人员能够在单细胞分辨率研究复杂生物系统中细胞的异质性，但在实验过程中需要经历组织消化等操作，导致细胞在组织中原始位置信息的丢失。新兴的空间转录组学技术则在定量基因表达水平的同时，保留了细胞的空间信息，研究人员得以在空间背景下研究细胞不同的功能状态以及细胞间的相互作用。然而，由于技术的限制，目前大多数空间转录组或是检
2022-03-12
CANCER DISCOV：通过基因组和转录组分析揭秘转移性乳腺癌(MBC)的复发过程！
近来Philippe Aftimos教授及其团队针对乳腺癌基因展开了相关研究，旨在通过对原发肿瘤和早期转移瘤进行多组学分析，研究转移性乳腺癌(MBC)的复发过程。
2022-01-18