Nature Communications：GapClust方法能够高效准确地从大量单细胞转录组中发现稀有细胞群体
近日，国际知名期刊《Nature Communications》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院俞章盛团队的研究成果“GapClust is a light-weight approach distinguishing rare cells from voluminous single cell expression profi
Science：利用sci-Space技术在单细胞水平上揭示细胞基因转录的空间分布模式
2021年7月6日讯/生物谷BIOON/---一项名为sci-Space的新技术与来自其他技术的数据相结合，可能会在哺乳动物胚胎发育过程中，通过不同细胞的基因表达绘制出四维图谱。这类图谱将描绘出单个细胞中的基因转录本如何反映出时间的流逝、细胞谱系、细胞迁移以及发育中的胚胎位置。它们还将有助于阐明基因表达的空间调节。哺乳动物胚胎发育是一种了不起的现象：一个受精
Genome Biology：揭示转录调节DNA复制起始的分子机制
DNA是主要的遗传物质，也是中心法则的源头。DNA代谢包括DNA复制、转录及DNA修复等。其中，DNA复制保证了遗传信息精确完整地传递，而转录则是细胞身份维持和功能调控的关键。DNA复制发生在整个染色质上，而转录则只发生在染色质上的转录区。如果这两个关键的细胞过程碰撞，犹如独木桥上狮虎相遇，会发生什么呢？研究表明，DNA复制和转录在转录区域的相遇会产生大量的
Cell：揭示整合到宿主基因组中的内源性逆转录病毒可控制宿主免疫系统和微生物群的互动方式
2021年6月30日讯/生物谷BIOON/---生活在身体表面（如哺乳动物的皮肤）的数十亿生物体---统称为微生物群（microbiota）---在一个复杂的网络中相互沟通，并与宿主免疫系统沟通。在一项新的研究中，来自美国和英国的研究人员鉴定出哺乳动物的一个可能调节组织修复和炎症的内部通信网络，从而为肥胖和炎症性皮肤病等疾病如何产生提供了新的见解。他们发现整
Journal of Genetics and Genomics：单细胞分辨率绘制水稻幼苗叶和根的转录组图谱
水稻作为重要的粮食作物，为全球一半以上的人口提供主粮；同时，水稻作为单子叶模式植物，其个体发育与细胞分化受到了科研人员持续和广泛的关注。细胞功能的分化常常可以体现为基因表达的差异。新兴的单细胞转录组测序技术使高通量探究细胞的功能分化成为可能。绘制水稻全苗单细胞转录图谱将为单子叶植物的研究工作提供关键的基础资源，为理解植物发育的转录调控
Protein & Cell：绘制出灵长类海马衰老的单细胞转录组图谱
海马体作为脑的重要组成部分，在学习和记忆中发挥重要作用。随着年龄增长，海马功能逐渐退化，导致认知功能的减退以及多种人类神经退行性疾病发生。由于海马结构复杂，细胞组成具有高度异质性，传统研究技术难以精确揭示海马衰老过程中不同细胞类型的衰老规律及分子调控网络。此外，由于伦理及样本来源的限制，不同年龄阶段的健康人类海马组织很难获取，这在一定
胰岛素基因转录调控通路进化研究取得进展
Nature Communications以Evidence from oyster suggests an ancient role for pdx in regulating insulin gene expression in animals为题，在线报道了中国科学院海洋研究所副研究员许飞和英国等国家的科学家的合作研究成果。该研
Neuro-oncology：揭示垂体瘤转录组特征
垂体是最重要最复杂的内分泌腺体之一，主要由五种激素细胞组成，包括生长激素细胞、催乳素细胞、促甲状腺素细胞、促肾上腺皮质激素细胞和促性腺激素细胞，在生长发育、代谢调节、生殖以及应激等生理过程中发挥重要作用。每种激素细胞都有可能异常增殖形成肿瘤，即垂体神经内分泌肿瘤(Pituitary neuroendocrine tumors，PitNETs)，又称垂体腺瘤或
美国麻省理工：小分子靶向” 不可药物化”转录因子的研究进展
2021年5月21日讯/生物谷BIOON/---美国麻省理工在Nature Reviews | Drug Discovery杂志上发表了题为Advances in targeting 'undruggable' transcription factors with small molecules的综述性文章。在这里，作者回顾了目前对转录因子介导的基因调控的理
研究发布恒河猴参考基因结构 揭示人类转录本演化新机制
作为人类近缘的非人灵长类模式动物，恒河猴在脑科学、分子演化、药物研发等基础与转化研究中发挥着不可替代的作用。然而，目前恒河猴基因结构主要源于预测，严重制约了该特色模型在分子水平的研究与应用。近日，北京大学分子医学研究所李川昀教授课题组运用全长转录本测序技术，开发了生物信息学新方法，重新准确定义了恒河猴全长基因结构，并以此为基础探究了多聚腺苷酸化（polyad