Nature Methods | 解码基因调控新机制:系统性发现人类转录组中的RNA结构开关
该研究展示了RNA结构开关在基因表达调控中的重要性,并强调了开发新的RNA开关鉴定方法的必要性。未来,SwitchSeeker有望被应用于更广泛的转录组研究中,揭示更多关于RNA结构和功能的奥秘。
2024-07-20
Cell Metab | LRP1调控ARF1 K73乳酸化修饰影响星形胶质细胞线粒体外排
文章发现LRP1通过减少星形胶质细胞的乳酸生成,降低ARF1的乳酸化修饰水平,从而调控健康线粒体由星形胶质细胞向神经元的传递,这一过程可以拮抗缺血所造成的器官损伤。
2024-06-26
冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录及染色质动态图谱获得进展
中国科学院遗传与发育生物学研究所肖军研究组利用RNA-seq、ATAC-seq和CUT&Tag技术,绘制了田间冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录及染色质动态图谱。
2024-07-13
Dev Cell:余逸群/余洪猛/刘环海/任雯雯绘制嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱
该研究建立了哺乳动物嗅上皮衰老的单细胞转录组图谱(图1),解析嗅上皮细胞类型特异性的衰老相关差异表达基因,发现衰老导致嗅上皮中存在激活型HBC,揭示Egr1和Cebpb是转录调控网络中的核心因子。
2024-08-27
Cell:樊荣团队开发全球首个临床级福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的空间全转录组测序技术
在约2300种已知的人类成熟microRNA中,Patho-DBiT在MALT切片中检测到了1352种microRNA,其映射序列的长度峰值为21个核苷酸,与此类小RNA的已知长度完全一致。
2024-10-04
Nature:中外科学家联手揭示结直肠癌的预后基因组和转录组特征
在这篇首次发表的研究论文中,研究者发现了将近100个发生突变的癌症驱动基因。其中,9 个是结直肠癌中的新型基因,24 个是任何癌症的新型基因。
2024-08-15
Nature/PNAS等顶刊"新宠"——乳酸化修饰在肿瘤进展、免疫治疗作用机制等研究思路解析
此前在统计PubMed乳酸化研究的文章时发现,除综述外,肿瘤领域的乳酸化研究最多,约占1/3。我们将解析3篇高分文章,分析乳酸化修饰组学在肿瘤相关疾病研究中的应用思路。
2024-07-26