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​Nature子刊:浙江大学孙会增/王永成团队开发微生物单细胞转录学技术,揭示奶牛瘤胃微生物活性功能类群

该研究利用MscT技术,通过基于BGMGM的泛基因组功能基因比对策略,揭示了瘤胃微生物生态系统原位活性代谢功能类群。

2024-06-16

Nature:重庆大学印明柱团队绘制迄今最大规模泛癌种脉管系统单细胞图谱,揭示肿瘤血管生成的复杂过程

这项研究描绘了肿瘤血管系统的复杂性,为充分理解肿瘤血管生成的复杂过程提供了全景视角,对抗血管生成治疗具有潜在临床意义。

2024-07-15

单细胞和空间转录中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

Nature Methods | 何爱彬/舒绍坤团队合作开发单细胞药物基因靶点检测新技术解析表观耐药机制

scEpiChem提供了一个全面的高通量分析框架,捕捉了传统bulk分析无法实现的小分子药物反应的细胞异质性特征。

2024-07-20

Cell:开发出一种称为 Open-ST 的空间转录学平台,能够三维重建组织内细胞中的基因表达

Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法,可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐,可将组织重建为三维“虚拟组织块”。

2024-07-15

空间学技术破译阿尔茨海默病的重要风险因子!Mol Psych:首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析

此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑,使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。

2024-08-14

Nature:中外科学家构建出迄今为止最全面的人类衰老骨骼肌的单细胞图谱

肌肉可以自我修复。这主要是由肌肉干细胞完成的,它们在受伤后开始增殖并分化成肌肉细胞,所产生的肌肉细胞相互融合或与现有肌纤维融合,以修复受损肌肉。

2024-04-28

Cell Genomics:刘琦/严钢团队开发TCR和T细胞转录跨模态整合分析的AI框架——UniTCR

UniTCR提出了一种低质跨模态场景下的免疫组学有效整合和表征的AI框架,以赋能诸多免疫数字解码相关的下游任务分析。

2024-05-06

首次绘制出酵母基因编码蛋白在完整细胞周期中的精密运动与分布图谱

酵母作为真核生物的理想模型,其独特优势在于能够让我们观测到大规模的生物学过程,这是在其他更简单或更复杂的生物体中难以实现的。通过研究酵母细胞周期,有望深化对人类细胞周期机制的理解。

2024-05-02

Nat Methods | 单细胞三维基因与基因表达联合分析:北京大学谢晓亮等团队揭示嗅觉受体选择的动态过程

该研究结果揭示了一个值得注意的模式:在OSN发展过程中,OR增强子的可及性降低,表明只有一部分增强子在成熟的OSN中保持活性。

2024-04-17