Nat Cancer：王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱，揭示肝细胞癌微环境空间异质性
利用CODEX技术，研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色，分辨率达0.377 μm/pixel，一共获得了4,347,731个细胞，定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。
2024-10-03
科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法
STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具，在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。
2024-11-10
Nat Methods：scNanoSeq-CUT&Tag技术：可精准检测单细胞基因组复杂区域的染色质修饰
该研究开发了一种基于单分子测序平台的 scNanoSeq-CUT&Tag 新方法，可以精准检测单个细胞内染色质修饰特征，包括组蛋白修饰和转录因子的结合分布模式。
2024-10-12
Nature：重庆大学印明柱团队绘制迄今最大规模泛癌种脉管系统单细胞图谱，揭示肿瘤血管生成的复杂过程
这项研究描绘了肿瘤血管系统的复杂性，为充分理解肿瘤血管生成的复杂过程提供了全景视角，对抗血管生成治疗具有潜在临床意义。
2024-07-15
Nature：中外科学家构建出迄今为止最全面的人类衰老骨骼肌的单细胞图谱
肌肉可以自我修复。这主要是由肌肉干细胞完成的，它们在受伤后开始增殖并分化成肌肉细胞，所产生的肌肉细胞相互融合或与现有肌纤维融合，以修复受损肌肉。
2024-04-28
Nature Methods | 何爱彬/舒绍坤团队合作开发单细胞药物基因组靶点检测新技术解析表观耐药机制
scEpiChem提供了一个全面的高通量分析框架，捕捉了传统bulk分析无法实现的小分子药物反应的细胞异质性特征。
2024-07-20
Cell Genomics：刘琦/严钢团队开发TCR和T细胞转录组跨模态整合分析的AI框架——UniTCR
UniTCR提出了一种低质跨模态场景下的免疫组学有效整合和表征的AI框架，以赋能诸多免疫数字解码相关的下游任务分析。
2024-05-06
Cell：开发出一种称为 Open-ST 的空间转录组学平台，能够三维重建组织内细胞中的基因表达
Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法，可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐，可将组织重建为三维“虚拟组织块”。
2024-07-15