基于CRISPR/Cas9的单细胞谱系追踪，揭示癌症异种移植物转移的速率、途径和驱动因子
2021年1月25日讯/生物谷BIOON/---当癌症局限于身体的一个部位时，医生通常可以通过手术或其他疗法进行治疗。然而，大部分与癌症有关的死亡，是由于它的转移倾向，发送自己的种子，可能在全身生根。转移的确切时刻转瞬即逝，迷失在肿瘤中发生的数百万次分裂中。美国怀特黑德研究所成员Jonathan Weissman说，“这些事件通常是不可能实时监测的。”如今，
Science子刊：一种称为circ2082的环状RNA促进胶质母细胞瘤细胞生长
2021年1月13日讯/生物谷BIOON/---就像迪士尼经典动画片《小飞侠》中长不大的彼得潘（Peter Pan）一样，有些细胞永远不会长大。在癌症中，未分化的干细胞可能帮助胶质母细胞瘤等肿瘤变得比其他形式的疾病更具侵袭性。某些基因应当会帮助细胞走向成熟，但不会影响年轻的干细胞。这需要microRNA组（microRNAome ）---细胞中产生的所有mi
中山眼科中心肖传乐和刘奕志团队开发Nanopore测序数据新校正组装算法，并组装视网膜母细胞瘤的高完整度基因组
三代测序技术（PacBio和Oxford Nanopore）可解决基因组重复区域的组装难题，提高基因组完整性，已成为发育、再生、肿瘤和其它疾病过程中细胞基因组组装的主流技术。其中，纳米孔（Nanopore）测序技术的迅速发展更使得测序成本显着降低，并且由于其可实现超长读长（高达1Mbp），在复杂基因组组装中具有天然优势。然
步辐射单细胞红外显微成像研究获进展
单细胞技术因有望揭示“细胞功能异质性机制”这一生命科学的本质问题，从而解析各种慢性疾病（如癌症、糖尿病和神经退行性疾病）和衰老的分子基础，是当前生物医学的研究热点和重点方向。单细胞技术在测序方面取得了进展；由于该技术具有无须标记、非侵入性、可同时展示胞内代谢物（组）特征等优点，逐渐得到学界关注。近期，中国科学院上海高等研究院研究员吕军鸿课题组先后
我的命运我主宰，而细胞中的RNA分子也是如此
2020年12月18日讯/生物谷BIOON/---在人体的任何时刻，在大约30万亿个细胞中，DNA正在被“读取”成信使RNA（mRNA）分子，这是DNA和蛋白之间的中间步骤，这一过程被称为转录。科学家们对转录是如何开始的有了很好的了解：称为RNA聚合酶的蛋白被招募到DNA分子的特定区域，并开始沿DNA链移动，边走边合成mRNA分子。但是，这个过程的一部分还不
科学家首次实现活细胞RNA标记与无背景成像
癌细胞中mRNA水平与其编码蛋白质水平之间存在较低相关性，提示癌细胞的翻译调控显着失调，这为癌症的诊疗提供一种全新的思路。华东理工大学生物反应器工程国家重点实验室的杨弋、朱麟勇等教授历经7年合作研究，在荧光RNA及活细胞RNA成像领域获突破性进展。他们原创的系列高性能荧光RNA，在国际上首次实现了不同种类RNA在动物细胞内的荧光标记与无背景成像。
RNA+DNA同时测序 可检测癌症组织中的基因融合和碱基突变
当前的研究表明，诸如NTRK(神经营养因子受体酪氨酸激酶)等罕见的融合变异事件能有效地驱动肿瘤发生，并成为多种肿瘤中靶向治疗的靶标。基于DNA检测的大Panel可以覆盖几百个癌基因，是大规模探测突变的强有力工具，但在融合/重排检测方面仍具有一定挑战。靶向二代测序是一种能够综合鉴定癌症生物标志的方法，根据不同的变化情况，起始的检测材料可为DNA或
安捷伦基因组学系列讲座 —— 安捷伦RNA和DNA平行测序文库构建方案，一天当作两天用
利用DNA和RNA的平行靶向测序可以比对序列差异、验证基因融合，检测DNA突变的关联基因表达水平变化。利用SureSelect XT HS2 RNA建库试剂盒，结合之前推出的 XT HS2 DNA试剂盒就可以轻松实现DNA和RNA的平行建库，实现上述应用。
Immunity：新技术可帮助修复单细胞RNA测序的丢失数据
从单个细胞中测序RNA可以揭示有关这些细胞在体内做什么的大量信息。麻省理工学院的研究人员现在通过修改常用的Seq-Well技术，大大提高了从每个细胞收集的信息量。
Cell：对埃博拉病毒进行单细胞研究，揭示了这种病毒的致命策略
2020年11月15日讯/生物谷BIOON/---埃博拉病毒是世界上最致命的病原体之一。如今，在一项新的研究中，来自美国国家卫生研究院（NIH）、布罗德研究所、麻省理工学院和斯坦福大学等研究机构的研究人员报告了埃博拉病毒在感染过程中如何改变宿主免疫反应以有利于自己的新细节。他们鉴定出这种病毒抑制的抗病毒防御基因，以及这种病毒激活的其他基因，以便潜在地促进它在