研究开发出基于深度学习的单细胞转录组分析模型
单细胞转录组作为单个细胞的特征，可更加精确地定义细胞的类型。常规的基于单细胞转录组的分类方法首先是进行无监督的聚类，然后根据每个集群（Cluster）特异表达的细胞标记基因来对集群进行标注。虽然基于无监督的分类方法更容易发现新细胞类型，但是人工标注的过程费时费力。目前已有的基于监督学习的自动分类方法，大部分无法兼顾到方法的可解释性以及
Genome Med：单细胞RNA测序技术或能揭示胰腺肿瘤中单个细胞的特性 有望帮助开发个体化胰腺癌疗法
2020年10月11日 讯 /生物谷BIOON/ --近日，一篇发表在国际杂志Genome Medicine上的研究报告中，来自美国翻译基因组学研究院等机构的科学家们通过研究详细描述了组成胰腺癌微环境的单个细胞的特性，这或许有望帮助开发新型疗法来治疗这种侵袭性且难以治疗的癌症类型。图片来源：CC0 Public Domain文章中，研究人员利用一种名为单细胞
单细胞测序找到背后原因
黑色素瘤是最为致命的皮肤癌类型，且发病率不低——根据美国癌症学会的统计，每38名白种人里，就有1人会在生命中的某一时刻罹患黑色素瘤。如果发现得早，这种恶性肿瘤还可以通过手术切除。一旦它发生扩散，治疗手段就会大受局限。但要早期发现黑色素瘤并非易事。在很多人的意识里，黑色素瘤来源于痣的恶化。然而事实上，这只能解释部分黑色素瘤的起源。大部分黑色素瘤在发
中国科学家首次解析神经母细胞瘤单细胞图
神经母细胞瘤（NB）是神经-衍生的恶性肿瘤的一种亚型，是儿童时期最常见的颅外实体瘤。尽管进行了广泛的研究，NB的潜在发展起源仍不清楚。2020年9月17日，复旦大学研究团队在Cancer Cell 在线发表题为“Glial Metabolic Rewiring Promotes Axon Regeneration and Functional R
研究揭示RNA甲基化修饰调控哺乳动物精原干细胞微环境维持机制
近期，中国科学院西北高原生物研究所研究员杨其恩课题组以小鼠为模型，揭示RNA甲基化修饰调控哺乳动物精原干细胞微环境维持的新机制。成体干细胞命运决定受到特殊微环境调控，在大多数组织中，微环境的形成和维持机制并不明确。精原干细胞是一类经典的成体干细胞，是哺乳动物精子发生的基础。精原干细胞自我更新和分化间的精准平衡依赖于体细胞信号，尤其是支持细胞分泌的
研究揭示RNA m6A修饰调控人干细胞衰老的新机制
N6-甲基腺嘌呤（m6A）是真核生物RNA上较为常见的一类转录后表观修饰，其建立、擦除和识别分别受到m6A甲基转移酶（writer）、去甲基化酶（eraser）以及结合蛋白（reader）的动态调控。已有研究表明，m6A作为基因表达调控中的重要节点，通过调节靶RNA的出核、稳定性、选择性剪接和翻译过程，参与调控诸多生物学事件，而关于m6A在衰老特
科学家们成功在单细胞分辨率下解析机体肠道神经系统的奥秘！
2020年9月29日 讯 /生物谷BIOON/ --整个胃肠道系统中嵌入的是一种更为广泛的神经元阵列，其会协调几乎所有的活动，包括消化、肠道运动以及对有害刺激的反应等，这些细胞就组成了肠道神经系统（ENS，enteric nervous system），并能将信号传输到大脑中，但其非常稀少且很脆弱，很难进行分离和深入研究，近日，一项刊登在国际杂志Cell上题
Cell Rep：单细胞测序预测化疗的有效性
在最近一项研究中，来自密歇根大学的Jun Hee Lee博士课题组使用一种单细胞RNA测序的技术，首次展示了单个癌细胞群中的各个细胞对化学疗法引起的DNA损伤的基因表达差异。他们发现，这些反应可以被分为三类：激控制细胞死亡，细胞分裂或应激反应。相关结果发表在最近的《Cell Reports》杂志上。
科学家发现人类细胞表面稳定附着RNA分子
众所周知，人类细胞的外表面上有很多不同的蛋白质、脂质、糖蛋白。然而除了这些已知类型的分子，近日科学家们发现，人类细胞的外表面还稳定附着了一类过去鲜有人知的RNA分子。根据在Genome Biology正式发表的一篇研究论文，加州大学圣地亚哥分校（UCSD）钟声教授与其合作者张良方教授、陈真教授共同领衔的研究团队，利用专门开发的检测和测序技术鉴定出
NEJM：单细胞测序揭示线粒体疾病发生机制
在最近一项研究中，马萨诸塞州总医院（MGH）的人员在发现了有关一类线粒体疾病的新致病机制。线粒体疾病是一种遗传性疾病，会干扰体内能量的产生，目前尚无法治愈。该发现发表在《New England Journal of Medicine》上。