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拟南芥超级增强子的鉴定与功能验证研究取得进展

孟凡立团队利用拟南芥DNase I超敏感位点测序数据,在拟南芥全基因组范围内查找含有大的增强子簇的染色质开放区域,鉴定出749个候选超级增强子,最小的长度为1.5Kb。

2022-11-25

【核酸研究】超级增强子驱动的lncRNA-Daw通过激活Wnt/b-catenin途径促进肝癌细胞增殖

长非编码RNA(LncRNAs)在多种肿瘤中的异常表达已有报道。然而,超级增强子介导的潜在机制仍然不清楚。在这里,作者试图定义一种名为lncRNA-Daw的新型lncRNA在肿瘤发生中的作用。

2021-12-28

Nature:靶向SWI/SNF ATP酶有望治疗对增强子成瘾的癌症

虽然科学家们已确定了几个驱动前列腺癌的基因,但是在一项新的研究中,来自美国密歇根大学的研究人员揭示了控制绳线的木偶主人。这些绳线是致癌基因,比如雄激素受体、FOXA1、ERG和MYC。木偶主人是一种称为SWI/SNF的染色质重塑复合物,它控制着DNA的排列和压缩以适应细胞核的方式。

2021-12-30

大肠癌的全基因组分析表明,PHF19和TBC1D16是致癌的超级增强子

大肠癌是世界上最常见的癌症之一。尽管基因组突变和单核苷酸多态性已被广泛研究,但结直肠癌患者组织中的表观基因组状态仍然难以捉摸。

2021-11-15

Cancer Res:特殊miRNA分子或能通过靶向作用超级增强子来治疗MYC驱动的癌症

来自东京医科牙科大学等机构的科学家们通过研究识别出了一类称之为miRNA的特殊RNA分子,其或能作为潜在的抗癌疗法;研究者指出,名为miR-766-5p的miRNA分子或能明显降低癌基因MYC的水平,MYC是一种在肿瘤细胞中能高水平表达的特殊基因,其能帮助促进癌症生长和进展。

2021-10-09

Nature:提出新的增强子选择启动的模型

增强子与启动子是高等动物尤其是人类中最重要的两类基因表达调控元件。它们之间的有效互作可保证基因的准确转录,从而保证细胞状态和正常发育。它们之间的错误联系也同样可以导致疾病相关的基因表达异常。因此,了解增强子选择启动子的机制可帮助更好地认识健康与疾病。美国德克萨斯大学休斯敦健康科学中心麦戈文医学院的李文博研究组和加州大学圣地亚哥分校Michael Rosenf

2021-09-12

Genes & Development:发表增强子eRNA调控三维基因组重要研究进展

增强子是人类基因组中一大类非常重要的顺式调控元件,能够参与染色质的空间折叠和基因的表达调控。在人类基因组中存在着成千上万的增强子,它们在组织器官发育过程的基因调控中起到重要作用。上世纪90年代,研究者发现增强子能够转录出RNA。直至2010年,增强子转录出的RNA才被命名为eRNA。在eRNA刚被发现的时候,它们被当成不具有生物学功能的转录“副产物”。随着研

2021-09-18

Nature刊:转录增强子控制鳞状细胞癌的癌干性和转移基因

肿瘤干细胞(Cancer stem cells, CSCs)在头颈部鳞状细胞癌(HNSCC)侵袭性生长和转移中起着至关重要的作用。尽管在了解CSCs的自我更新和致瘤潜能方面已经取得了重大进展,但如何有效地消除CSCs和阻止转移仍然是一个关键的挑战。在这里,作者发现超级增强子(SEs)在癌症干细胞基因和前转移基因的转录中发挥了关键作用,从而控制了它们的致瘤潜能

2021-07-08

Sci Adv:科学家识别出人类巨噬细胞炎性增强子的“守卫蛋白”—EGR1

2021年1月19日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一项刊登在国际杂志Science Advances上的研究报告中,来自美国威斯达研究所等机构的科学家们通过研究发现,一种在血细胞发育期间能开启和关闭特殊基因表达的蛋白—EGR1(早期生长应答因子1,Early Growth Response 1)或能抑制巨噬细胞中促炎性基因的表达。作为保护机体抵御病原

2021-01-19

新研究揭示增强子在动物体内是非常保守的

2020年11月14日讯/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,来自澳大利亚昆士兰大学、新南威尔士大学、莫纳什大学、墨尔本大学、悉尼大学和张任谦心脏研究所的研究人员发现称为增强子的基因调控元件的功能在进化树上分布的动物物种中广泛保守。当他们将来自海绵动物的增强子序列插入斑马鱼和小鼠体内时,这两种脊椎动物都能够解释遗传信息,并驱动发育基因的细胞特异性表达,

2020-11-14