Nat Cell Biol：赵方庆团队开发基于编程控制的转录组实时测序新技术
该研究首次提出了转录组智能测序的概念，依托人工智能纳米孔自适应测序算法，能够实时判断测序分子来源，并可编程选择目标测序分子进行全长测序。
2024-11-03
Cell Rep：刘行/姚雪彪/王志凯合作揭示细胞更新转录调控新机制
该研究发现了书签标识因子FOXA1在细胞有丝分裂期过程中DNA结合模式转变的磷酸化调控机制，以及FOXA1转录凝聚体的形成与功能发挥的分子基础。
2024-09-22
Mol Cell：HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子
HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域，从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制，最终激活多个癌症驱动基因，驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。
2024-11-07
Cell Metab：吕德官等揭示胶质母细胞瘤中调控表观转录的关键代谢途径
该发现揭示了MDH2是维持GSCs代谢和表观转录组网络的关键环节，为开发更为有效的靶向治疗方案铺平了道路。
2024-11-06
Nature Genetics：赵方庆团队开发高通量三维空间转录组新技术
MAGIC-seq提出了“拼接芯片”的概念，即通过调整网格间距和多轮编码的方式将多个捕获网格拼接在一起，突破了传统微流控方法的通道限制，实现了高分辨率与大视野的兼顾。
2024-09-13
Nature Methods | 全面评估长读长RNA测序：揭示转录组分析新前沿
LRGASP项目通过系统评估多种长读长RNA测序技术和分析工具，提供了对当前最佳实践的深入理解和未来改进的方向。
2024-06-12
研究发现在翻译水平调控T细胞死亡的关键因子
该研究筛选并鉴定出FAS介导的T细胞死亡过程中的关键调控蛋白AMBRA1，揭示了AMBRA1在翻译水平控制TCR信号传导、T细胞周期和T细胞死亡的新机制。
2024-11-11
科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法
STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具，在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。
2024-11-10
Dev Cell | 同济大学陈嘉瑜/高绍荣/江赐忠/高睿等揭秘TFAP2C在小鼠着床期间转录因子网络的中心角色
该研究清楚地阐明了以TFAP2C为中心的TF网络对早期胚胎发育的微调调控，该网络连接配子遗传代谢基因、亲本遗传环境和表观基因组，共同调节早期胚胎发育。
2024-04-09