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Science:利用单细胞染色质图谱揭示原发性人类癌症中的恶性调控程序

多种人类原发性癌症类型的 TCGA 单细胞图谱和用于解释癌症中顺式调控元件的可解释深度学习模型,为了解导致原发性人类癌症恶性表型的分子程序提供了新的资源。

2024-09-27

冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录染色质动态图谱获得进展

中国科学院遗传与发育生物学研究所肖军研究组利用RNA-seq、ATAC-seq和CUT&Tag技术,绘制了田间冬小麦春化建立、维持和重置过程中的转录及染色质动态图谱。

2024-07-13

Nat Cell Biol丨蓝勋和孟安明合作开发高通量、低成本SPATAC-seq技术并绘制斑马鱼早期胚胎发育染色质图谱

SPATAC-seq是一种基于单细胞组合索引(Single-cell combinatorial indexing)原理设计开发的单细胞染色质可及性技术。

2024-07-16

Nat Methods:scNanoSeq-CUT&Tag技术:精准检测单细胞基因组复杂区域的染色质修饰

该研究开发了一种基于单分子测序平台的 scNanoSeq-CUT&Tag 新方法,可以精准检测单个细胞内染色质修饰特征,包括组蛋白修饰和转录因子的结合分布模式。

2024-10-12

当小鼠胚胎长出额外的双腿:揭秘胚胎发育中的染色质变化

该研究通过探索Tgfbr1在调控小鼠后肢和外生殖器之间的发育可塑性中的作用,对遗传学、发育生物学和进化论做出了重要贡献。

2024-04-05

科研人员揭示染色质修饰感知细胞能量代谢水平控制植物环境适应的表观调控机制

在本研究发现ADA2赖氨酸乙酰化,控制其蛋白在细胞中的积累水平,影响组蛋白乙酰转移酶活性,是感知植物在不同生长条件下细胞能量水平的变化调控染色质修饰动态平衡和基因表达的机制。

2024-02-27

研究人员开发出基于单分子测序平台的scNanoHi-C技术,精准检测单细胞高阶染色质互作

真核生物基因的表达受到基因组中顺式作用元件的复杂调控。哺乳动物基因组中存在大量的顺式作用元件,例如:启动子、增强子、沉默子、绝缘子等等,其数量远远超过蛋白编码基因。

2023-09-18

Cell:DDM1对组蛋白H3变体的染色质重塑实现植物DNA甲基化的跨代表观遗传

当有机体将它们的基因传给后代时,它们传递的不仅仅是 DNA 中的代码。有些有机体还会传递化学标记来指示细胞如何使用这些代码。将这些化学标记传递给后代被称为表观遗传(epigenetic inherit

2023-09-19

染色质扩展显微镜技术解开基因组秘密

开启或关闭基因的能力是我们在细胞、个体甚至在健康和疾病方面观察到的多样性的基础。这个过程被称为基因转录,涉及到将储存在我们的DNA中的信息转化为RNA。

2023-07-14