研究揭示胰腺癌染色质开放性特征
该研究首次系统性揭示胰腺癌的染色质开放性特征,并通过整合基因组学、转录组学和药物敏感性等多组学数据提出不同亚型胰腺癌的基因调控网络及潜在治疗靶点。
我国科学家描绘拟南芥芽再生染色质状态动态图谱
未来作物设计发展迅速,但植物再生效率低逐渐成为该项技术的关键问题。在以往的研究中,植物芽的再生过程经历了转录水平的大规模重塑,然而生长素和细胞分裂素如何在染色质水平依次调控外植体(离体植物组织)体细胞的命运转变仍不清楚。近日,发表在《Developmental Cell》上的一项题为“Dynamic chromatin state profili
Nat Cell Biol:抑制染色质调节酶EZH2有望治疗侵袭性癌症
在一项新的研究中,来自美国北卡罗来纳大学和西奈山伊坎医学院的研究人员发现了一种名为EZH2的染色质调节酶在癌症产生过程中的新作用。他们随后开发了一种新的治疗方法,即使用这种酶的强效小分子抑制剂。
Cell:科学家绘制人类单细胞染色质可及性图谱
在人类细胞中,总长约2米的基因组DNA通过与组蛋白缠绕形成核小体,并经过螺旋折叠等方式盘绕形成染色体进而团聚于直径10微米的细胞核中。在细胞内的DNA需要进行转录等活动的时候,DNA才会从组蛋白中释放出来,裸露出需要与转录因子结合的位点从而便于转录,染色质的这种特性叫做染色质可及性,暴露的区域被称为“开放染色质”。作为转录
Cell:新研究构建出人类基因组中的单细胞染色质图谱
在一项新的研究中,来自美国加州大学圣地亚哥分校的研究人员为人类基因组构建出单细胞染色质图谱。染色质是真核细胞中发现的由DNA和蛋白组成的复合物;在某些细胞核内,关键基因调控元件所在的染色质区域以开放的结构出现。在不同人类组织类型的细胞中精确地确定这些可访问的染色质区域将是理解基因调控元件(非编码DNA)在人类健康或疾病中的作用的重要一步。
Science Advances:揭示基因组“无用”序列稳定染色质三维结构及细胞稳态机制
人类基因组中的非编码序列在多种生物学过程中发挥着至关重要的作用,如非编码RNA、启动子、增强子和转座子等。作为在基因组中占比约98%的非编码区域,仍有大量是功能未知的,这些曾被认为是基因组中“垃圾”的区域,已被逐渐证实存在重要功能。基因组的三维结构会影响基因的转录调控或其他细胞生命活动,然而,除了研究较多的增强子-启动子成环所形成的三
中山医学院丁俊军教授团队系统绘制相分离溶解与重建过程的染色质三维结构图谱
细胞内广泛存在相分离(Phase Separation)现象,成千上万的蛋白或核酸分子在复杂的细胞内部形成一个一个无膜“隔间”,就像油滴在水中一样,彼此互不干扰地参与细胞内如转录调控、应激、蛋白质质量控制、DNA复制等多种重要的生物学过程。1,6-己二醇(1,6-HD)是一种能够使得相分离液滴溶解的化学小分子,它是目前唯一的能同时破坏多种相的工具,所以非常有
研究揭示人类衰老细胞空间基因组表观调控核心机制并绘制衰老相关染色质全局景观图谱
中国科学院上海营养与健康研究所研究员孙宇课题组经合作研究在Nature Aging上,在线发表题为KDM4 Orchestrates Epigenomic Remodeling of Senescent Cells and Potentiates the Senescence-Associated Secretory Ph
Immunity:单细胞染色质可读性图谱分析揭示调节性T细胞参与组织修复的分子机制
众所周知,组织中的调节性T细胞(Treg)对于促进组织稳态和再生具有重要作用。在最近一项研究中,来自德国雷根斯堡大学再生医学中心的Markus Feuerer及其团队揭示了健康组织中具有上述功能的Treg细胞的特征。通过研究鼠和人来源的组织特异性Treg细胞的单细胞染色质可阅读性(accessibility),从而定义了一个保守的,不依赖微生物群的组织修复性