首次构建出哺乳动物单细胞染色质可接近性图谱
2018年8月26日/生物谷BIOON/---科学家们对DNA缠绕和包装到所谓的染色质中的方式感兴趣,这是因为这会影响每个细胞中可用到的遗传信息。DNA就像串在一根绳子上的念珠。在这些分子“念珠”移动的地方会有空间形成,这样蛋白就能够访问和“读取”遗传信息。这种状态或者说这种基因组特征就是染色质可接近性(chromatin accessibility, 也译作染色质开放性)。在一项新的研究中,来自
利用sci-CAR方法同时分析上千个细胞中的转录组和染色质可接近性
2018年9月6日/生物谷BIOON/---不同细胞类型的基因组可能是相同的,但是它们的表观基因组和转录组不是相同的。表观基因组由一组影响每个细胞的基因组发挥何种功能的标记组成,而转录组指的是在某一特定条件下,细胞内所有转录产物的集合。转录产物经翻译后会产生蛋白。在RNA转录过程中,细胞仅能够接近它们的染色质包装的双链基因组的某些部分。鉴于这种接近在不同细胞类型之间存在着变化,因此染色质可接近性有
Nature:测量单个细胞的染色质可接近性,从而揭示胚胎发育路径
2018年3月25日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,美国华盛顿大学和位于德国海德堡市的欧洲分子生物学实验室的研究人员证实细胞类型和发育阶段能够从数千个单细胞的染色质可接近性(chromatin accessibility, 也译作染色质开放性)测量中推导出来。他们利用这种方法发现正在发育的胚胎中的细胞如何调节它们的身份,从而决定着它们变成什么类型的细胞。相关研究结果发表在2018年3月
APL 细胞外染色质使凝血及纤溶恶化
急性早幼粒细胞白血病细胞外染色质促凝血,部分结果刊登在同期杂志的封面上。(图片来源:史家岚)急性早幼粒细胞白血病(APL)常伴发危及生命的血栓及出血。尽管在过去的几十年中, APL 缓解率已达 90%,成为高度可
JBC:中科院朱冰团队发现表观遗传系统选择性保护常染色质区
在一项新的研究中,中国科学院生物物理研究所朱冰团队在野生型粟酒裂殖酵母菌株中,异染色质区中的突变率要高于常染色质区(euchromatin),但是这种不一致性在存在错配修复缺陷的粟酒裂殖酵母菌株中减弱了。这表明细胞内的错配修复机制偏好地保护常染色质区中的基因保真度。
Nat Commun:开放染色质分析可帮助找到白血病细胞起源
每种癌症都起源于单个细胞,Jackson实验室(JAX)的研究人员最近发现一种精准可靠的方法能够找到导致白血病发生的细胞起源,对于癌症诊断和结果判断都有很有帮助。他们使用的这种新方法叫做开放染色质的全基因组分析。相关研究结果发表在国际学术期刊Nature Communication上。
J Cell Biol :染色质相关蛋白在涡虫成体干细胞调控及再生过程中发挥重要作用
近日,国际权威细胞生物学杂志Journal of Cell Biology发表了健康所荆清课题组题为“Heterochromatin protein 1 promotes self-renewal and triggers regenerative proliferation in adult stem cells”的最新研究结果。
Nature:染色质组织方式决定肿瘤细胞区域性突变率
7月22日,Nature杂志在线报道,染色质组织方式对人类癌细胞中区域性突变率具有重大影响。 癌症基因组测序,提供了人类体细胞整个基因组的基因突变率差异的第一手资料。通过检测各种遗传学和表观遗传学指标,研究者发现,癌症细胞基因组的基因突变率与染色质组织方式存在惊人的相关性。