研究发现BAF扰动改变染色质可及性
奥地利科学院CeMM分子医学研究中心Stefan Kubicek和Sandra Schick研究组合作取得最新进展。他们表明急性编码BRG1 / BRM相关因子(BAF)扰动会导致染色质可及性即可变化。近日出版的《自然-遗传学》杂志发表了这一最新研究成果。他们使用dTAG系统诱导BAF亚基的急性降解,并证明染色质改变的建立速度快于一个细胞周期的持续时间。使用
科学家利用纳米孔测序同时获取染色质可及性和甲基化信息
近年来随着DNA测序技术的蓬勃发展,蛋白质结合位点的高通量鉴定、染色质可及性及甲基化状态分析等检测技术不断涌现,其中很多技术(如DNase-seq和ATAC-seq等)依赖于开放性染色质对转座酶等的敏感性。在这些新技术中,全基因组核小体定位及DNA甲基化组测序技术(NOMe-seq)能够利用外源性M. CviPI GpC甲基转移酶标记基因组可及性
研究揭示核纤层蛋白对人源细胞中染色质高级结构及染色质运动状态的调控
细胞核内DNA完全展开长达2米,而一般细胞核的直径仅有10—20微米,因此基因组在细胞核内处于高度折叠的状态,同时不断发生运动变化。染色质的三维结构具有有序性和动态变化性,构成细胞核中各种生物学过程的全新调控层次。通过成像和高通量测序技术,研究者发现染色质高级结构分为染色质环(Loop)、拓扑关联域(Topologically associati
两篇Science论文构建出胎儿基因表达和染色质可及性的人类细胞图谱,有助揭示人细胞生长和发育机制
2020年11月16日讯/生物谷BIOON/---在两项新的研究中,来自美国华盛顿大学医学院和布罗特曼-巴蒂精准医学研究所等研究机构的研究人员构建出两个细胞图谱,用于追踪人类细胞类型和组织发育过程中的基因表达和和染色质可及性(chromatin accessibility,也译为染色质可访问性)。其中的一个细胞图谱绘制了15种胎儿组织中单个细胞内的基因表达,
研究发现节律性调控染色质重塑和脂代谢基因表达的分子开关
5月4日,国际学术期刊Nature Metabolism 在线发表了中国科学院上海营养与健康研究所丁秋蓉课题组的研究论文“MRG15 orchestrates rhythmic epigenomic remodeling and controls hepatic lipid metabolism”。该研究发现MRG15作为一个进化上保守的表观调控因子在调控肝
染色质结构形成及DNA复制叉稳定性维持的分子机制研究获进展
100年前,研究人员发现染色体上有非常紧密的区域,并提出了异染色质结构这个概念(Montgomery TH. (1901), A study of chromosomes of the germ cells of metazoan. Trans Am Phil Soc. 20: 154-136; Heitz E. (1928). Das heterochromatin der Moose. I.
研究揭示拟南芥基因组加倍导致的三维染色质结构及基因表达调控特征
6月11日,《核酸研究》(Nucleic Acids Research)杂志在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心/植物生理生态研究所植物分子遗传国家重点实验室方玉达研究组题为The effects of Arabidopsis genome duplication on the chromatin organization and transcriptional regulation 的研
Cell:利用uliCUT&RUN方法在单细胞和单个胚胎中构建染色质上的蛋白结合图谱
2019年4月24日讯/生物谷BIOON/---在一项新的突破性研究中,来自美国匹兹堡大学和马萨诸塞大学医学院的研究人员对一种称为CUT&RUN(cleavage under targets and release using nuclease)的方法进行改进,使得在使用少量细胞(包括单细胞和单个植入前胚胎)的情形下,它适合用来研究转录因子和其他的DNA结合蛋白在染色质上的占据情况。相关研
CRISPR J:将Cas9与染色质调节肽进行融合,可提高CRISPR-Cas9编辑效率
2019年2月24日讯/生物谷BIOON/---通过Cas9核酸酶靶向感兴趣位点的CRISPR基因组编辑工具在效率上差异很大。在一项新的研究中,来自MilliporeSigma公司的研究人员报道一种新的称为CRISPR-chrom的染色质调节肽(chromatin-modulating peptide, CMP)融合策略可将CRISPR-Cas9的基因组编辑活性提高数倍。CRISPR-chrom是
人类原发性癌症染色质可接近性图谱揭示DNA-蛋白结合与癌症发生存在着关联
2018年10月27日/生物谷BIOON/---癌症是世界范围内死亡的主要原因之一。尽管2%的编码蛋白的人类基因组已被广泛研究,但是关于癌症中的非编码基因组(占人类基因组的98%)和基因调控,仍然有很多是未知的。通过转录因子(transcription factor, TF)作用于分散在非编码基因组中的发挥着长程影响的DNA调节元件,基因在适当的细胞类型和细胞状态中打开和关闭。癌症基因组图谱(Th