Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
Cancer Discovery:上海交大瑞金医院卢敏团队建立p53靶向药物研究规范
研究指出p53恢复剂研究中缺失的科学逻辑、长期以来对p53突变体的误解、p53恢复剂的研发障碍、p53恢复剂有效性的评估标准、p53恢复剂的临床试验规范、p53恢复剂的研发经验教训、p53的成药前景。
Nature:识别出细胞生长的精确时间或能帮助理解癌症的起源
本文研究中,研究人员提出了一种多模式框架,其或能为进行体内记录奠定一定的基础,将合成性或自然不可去除的遗传变化与单细胞分析结合起来,从而就能帮助探索哺乳动物系统发育和肿瘤发生的起源和时间。
“睡”出健康!J Diabetes研究表明:健康睡眠成为糖尿病患者的“心脏护盾”
本研究首次揭示了糖尿病患者健康睡眠模式与AMI死亡风险的关系,强调了充足睡眠等良好睡眠习惯的重要性,为临床和公共卫生实践中制定睡眠指导方案提供了科学依据。
Mol Cell:HOXDeRNA 通过与基因组广泛结合激活癌症转录程序和超级增强子
HOXDeRNA通过rG4结构结合EZH2并招募到PRC2标记的基因组区域,从而去除PRC2对关键胶质瘤转录因子和超级增强子的抑制,最终激活多个癌症驱动基因,驱动星形胶质细胞向胶质瘤转化。
Cell Metab:吕德官等揭示胶质母细胞瘤中调控表观转录的关键代谢途径
该发现揭示了MDH2是维持GSCs代谢和表观转录组网络的关键环节,为开发更为有效的靶向治疗方案铺平了道路。
Science:我国学者在河南发现水熊虫新物种,并揭开其超强抗辐射能力的分子机制
该研究通过多组学(基因组、转录组和蛋白质组)数据挖掘和功能验证,揭示了新发现的水熊虫物种河南高生熊虫辐射耐受的三种机制。
Nat Cell Biol:赵方庆团队开发基于编程控制的转录组实时测序新技术
该研究首次提出了转录组智能测序的概念,依托人工智能纳米孔自适应测序算法,能够实时判断测序分子来源,并可编程选择目标测序分子进行全长测序。
Cell:细胞因子IL-4让卵巢癌对免疫疗法产生抵抗性,靶向IL-4有望可能克服这一点
Perturb-map 结合了最先进的空间成像技术,增强了传统的基因编辑 CRISPR 筛选技术,即同时对数百个基因进行“扰动”。
Nature子刊:浙大熊旭深团队开发基于Transformer的语言模型,预测翻译调控并解析疾病变异
该深度学习模型Translatomer为领域提供了研究基因翻译调控的新工具,还为解释复杂疾病中的遗传变异提供了除了mRNA水平之外的重要机制基础。