首个全球人群基因组多样性和祖源信息数据库发布
11月3日,中国科学院上海生命科学研究院(人口健康领域)计算生物学研究所徐书华课题组的研究成果,以PGG.Population: a database for understanding genomic diversity and genetic ancestry of human populations为题,在线发表在《核酸研究》上。该研究分析了涵盖全球范围107个国家的356个人类
震惊!在我们的身体里,近三分之一的基因在男女中表达不同!
2017年11月15日/生物谷BIOON/--大多数人都知道男女之间存在遗传差异。男人有X和Y性染色体,而女人则拥有两条X染色体。我们知道,这些染色体上的基因在男女中不同。不过最近一篇文章表明,除了X和Y染色体上的基因外,还有第三个"染色体组"在男性和女性中表现出非常大的差异。这些新数据将对科学、医学甚至性别平等问题都可能带来挑战。图片来源:www.shutterstock.com人类基因组事实上
基于二代测序平台新技术SSRseq™,引领SSR分析新方向
摘要:当生命科学迈入到ATCG时代之后,目前常用的“跑电泳,比大小”的SSR检测技术,已经无法满足科研工作者对“准确、高效、定量”的要求。高通量测序技术的发展,让这一目标成为现实。上海天昊生物创新技术—SSRseqTM,基于主流二代测序平台开发,把SSR的“序列信息”及“比例信息”一网打尽,引领了SSR基因分型技术的革新发展。 什么是SSR?SSR (Simple Sequence Re
Nat Genet:猴子基因研究或有望帮助阐明机体抵御HIV的防御机制
2017年11月3日 讯 /生物谷BIOON/ --在非洲和加勒比地区发现的长尾黑颚猴 (vervet monkeys)是猿猴免疫缺陷病毒(SIV)的天然宿主,而SIV和HIV/AIDS非常相近,并不像携带HIV的人类一样,感染 SIV的长尾黑颚猴很少会像人类患上AIDS一样出现疾病症状。图片来源:medicalxpress.com近日,一项刊登在国际杂志Nature Genetics上的研究报告
Nat Genet:新方法可校正CRISPR筛选的癌症基因依赖性数据中的假阳性
图片来自Lauren Solomon, Broad Communications,改编自Meyers RM, Bryan JG, et al. Nature Genetics 2017。2017年11月3日/生物谷BIOON/---在一项新的研究中,布罗德癌症依赖性图谱(Broad Cancer Dependency Map)团队将来自342种癌细胞系的基于CRISPR的数据添加到他们不断增加的癌
同济大学刘琦教授课题组在Cell旗下刊物《Trends in Pharmacological Science》发表论文系统探讨肿瘤免疫检查点抑制剂疗效预测的计算生物学问题
肿瘤免疫治疗被认为是近年来癌症治疗手段中最有希望的方法之一。免疫检查点抑制剂(immune-checkpoint blockade)通过解除肿瘤细胞对免疫细胞的抑制通路,激活免疫细胞消灭肿瘤。虽然免疫检查点抑制剂在多类肿瘤治疗中表现出了令人振奋的临床效果,但在实际应用中仍然会出现响应率低,个体化差异大等临床问题。如何基于特定的biomarkers以及计算模型,对于肿瘤患者进行有效的个体化的免疫检查
重磅解读RNA编辑系统CRISPR-Cas13a发展脉络
2017年10月25日/生物谷BIOON/---CRISPR/Cas系统是目前发现存在于大多数细菌与所有的古菌中的一种免疫系统,被用来识别和摧毁抗噬菌体和其他病原体入侵的防御系统。在CRISPR/Cas系统中,CRISPR是规律间隔性成簇短回文重复序列(clustered regularly interspaced short palindromic repeats)的简称,涉及细菌基因组中的独特
JACI:为何儿童会对花生过敏?全基因组关联性研究助力寻找遗传发病原因
2017年10月12日 讯 /生物谷BIOON/ --近日,一篇发表在国际杂志Journal of Allergy and Clinical Immunology上的研究报告中,来自英属哥伦比亚大学和麦吉尔大学的研究人员通过研究发现了和机体花生过敏相关的一种新型基因,研究者表示,这种新型基因或许在机体食物过敏的发生上扮演着关键角色,相关研究或为后期开发新型过敏症的诊断策略和疗法提供一定研究基础。图
Nat Genet:为何榴莲闻起来如此“臭”?科学家全基因组测序找原因!
2017年10月11日 讯 /生物谷BIOON/ --日前,发表在国际著名杂志Nature Genetics上的一篇研究报告中,来自新加坡国立癌症中心等机构的研究人员通过研究首次完成了对榴莲全基因组图谱的解析,榴莲是一种珍贵的热带水果,素有“水果之王”的称号。图片来源:Kevin Lim, Yong Chern Han, Cedric Ng研究者Teh Bin Tean表示,作为一名遗传学家,我对
中心法则六十年:克里克改变了现代生物学
1957年9月,英国科学家弗朗西斯·克里克(Francis Crick)做了一个演讲,他介绍了关于基因功能的关键思想,特别是他所说的中心法则。这些想法到如今,仍然诠释了我们如何理解生命科学。这篇文章探讨了他在这个有影响力的演讲中发展的概念,包括他的预测,我们将通过比基因较序列来研究进化,这是生命科学发展史上的重大转折。2017年9月是生物学史上关于中心法则的讲座的第六十年。1957年9月19日,在