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单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

Cell:清华大学李寅青/李丕龙团队揭示基因表达的“保温杯”——具有相分离能力双效应转录因子

这项研究揭示了一类具有相分离能力的dual-action TFs,它们通过选择性地招募转录核心组件,实现其独特的双效转录调节功能。

2024-04-21

张余/周菲等团队合作揭示叶绿体基因转录的分子机制

该研究从烟草叶绿体中纯化了PEP-PAP超复合物,并通过单粒子冷冻电镜(cryo-EM)方法测定了复合物的结构。

2024-03-07

Pharmaceuticals:常见的HIV逆转录酶抑制剂药物可能有助降低HIV感染者的阿尔茨海默病发病率

本研究了随着年龄增长而服用逆转录酶抑制剂和其他抗逆转录病毒联合疗法的 HIV 阳性患者,并提出了一个问题:他们中有多少人患上AD?

2024-04-26

CELL RESEARCH:解码人类脊髓发育过程中转录因子的时空调控

在发育中的人类脊髓中发现的 DAM 样小胶质细胞与多项研究中观察到的特化小胶质细胞群有显著的相似性。

2024-01-31

Cancer Discov | 北京大学汤富酬/周鑫揭示了结直肠癌分子亚型的表观遗传基础和特征转录因子

该研究系统地揭示了著名的iCMS和CIMP分类的CRCs的表观遗传学基础。

2024-03-12

Dev Cell | 同济大学陈嘉瑜/高绍荣/江赐忠/高睿等揭秘TFAP2C在小鼠着床期间转录因子网络的中心角色

该研究清楚地阐明了以TFAP2C为中心的TF网络对早期胚胎发育的微调调控,该网络连接配子遗传代谢基因、亲本遗传环境和表观基因组,共同调节早期胚胎发育。

2024-04-09

Cell:DNA引导的转录因子协同作用塑造了面部和肢体间充质

近段时间,来自斯坦福大学化学与系统生物学系的Seungsoo Kim教授及其团队通过比较人类和黑猩猩面部颅神经嵴细胞的增强子图谱,发现了其增减与增强子活性变化相关的图案,研究TF 协同结合的功能影响。

2024-01-29

Nat Aging | 华中科技大学王世宣/栗妍/戴俊揭示人类卵巢衰老的时空转录组学变化及FOXP1的调控作用

该研究提出了一个时空图谱,系统地描述了在卵巢生命周期的三个代表性阶段人类卵巢衰老的空间原型和细胞异质性:生殖年轻(18-28岁),中年(36-39岁)和老年(47-49岁)。

2024-04-11

Small|唐忠/宁峙彭/张天富:外泌体膜仿生纳米干细胞清除器用于抑制乳腺癌FLASH放疗后复发和转移

该研究开发了一种名为TAFL的仿生纳米平台,该平台构建了热敏脂质体和肿瘤衍生的外泌体的融合膜脂质体,共同负载AIE光热剂TPE-BBT和小分子药物Asp。

2024-02-20