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单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

Cancer Discov | 北京大学汤富酬/周鑫揭示了结直肠癌分子亚型的表观遗传基础和特征转录因子

该研究系统地揭示了著名的iCMS和CIMP分类的CRCs的表观遗传学基础。

2024-03-12

科研人员出小麦穗发育的转录调控因子

中国科学院遗传与发育生物学研究所研究员肖军团队通过结合多维组学、群体遗传学和基因功能解析等研究手段,提出了系统高效鉴定关键调控因子的策略。

2024-02-07

Nat Biotechnol:利用真核逆转录因子蛋白将转基因插入人类安全港位点,有望开发出安全高效的基因疗法

转录转座子是 DNA 片段,当转录为 RNA 时,它编码的酶会将 RNA 复制到基因组的 DNA 中——这是一个自我服务的循环,这使得基因组中充斥着逆转录转座子 DNA。

2024-02-26

来自麻雀的逆转录转座子可将DNA插入人类基因组安全港,为更安全的基因治疗奠定基础

研究团队开发了一种新型基因插入技术——“精确RNA介导的转基因插入”(PRINT)。

2024-02-27

CELL RESEARCH:解码人类脊髓发育过程中转录因子的时空调控

在发育中的人类脊髓中发现的 DAM 样小胶质细胞与多项研究中观察到的特化小胶质细胞群有显著的相似性。

2024-01-31

Cell:DNA引导的转录因子协同作用塑造了面部和肢体间充质

近段时间,来自斯坦福大学化学与系统生物学系的Seungsoo Kim教授及其团队通过比较人类和黑猩猩面部颅神经嵴细胞的增强子图谱,发现了其增减与增强子活性变化相关的图案,研究TF 协同结合的功能影响。

2024-01-29

Theranostics: Klotho衍生肽1通过转录后调控恢复Klotho表达抑制纤维化肾细胞衰老

本研究表明,KP1是一种新发现的Klotho衍生肽,通过恢复Klotho的表达来抑制细胞衰老。

2024-01-29

科研人员开发uCoTargetX技术实现单细胞多组蛋白修饰与转录并行检测

研究者在此基础上进一步优化革新,发展了uCoTargetX技术,在国际上率先实现单细胞多种组蛋白修饰和转录组的并行检测,为深入研究各种生理病理状态下细胞命运的表观调控提供了强有力的技术工具。

2024-01-16

science:研究氨基揭示早期胚胎先锋转录因子调控多能性程序的分子机制

通过优化CUT&RUN技术,研究者首先捕获了小鼠胚胎中多能性转录因子SOX2与染色质全基因组的结合位点

2024-01-03