单细胞技术解析肿瘤浸润免疫细胞新发现取得进展
肿瘤微环境具有高度异质性,深入理解肿瘤微环境特别是肿瘤浸润免疫细胞的特征,对探究肿瘤发生发展和免疫疗法的关键调控分子至关重要。近年来,单细胞转录组技术成为解析肿瘤微环境的有力武器,在相关研究中取得了一系列突破进展,包括揭示肿瘤浸润免疫细胞的异质性、动态变化关系以及这些免疫细胞在不同肿瘤免疫治疗中的潜在功能。近日,北京大学生物医学前沿创新中心(BIOPIC)、
余学清/张镇海/曹广文团队联合揭示人抗体组库的关键特征
广东省人民医院余学清团队、南方医科大学张镇海团队以及中国人民解放军海军军医大学曹广文团队联合在线发表了群体水平下人抗体组库特征谱的研究,揭示了包括基因使用率、基因重组偏好、公共克隆以及体细胞超突变在内的多个抗体组库的关键特征。国际学术期刊《细胞报告》在线发表了这一研究成果,博士生杨修佳为第一作者。抗体组库(Antibody reper
红杉+Illumina两大重量级IP联合加持,基因组学创业者的机遇来了!
在人类基因组计划草图首次发布的第20个年头,顶尖投资机构红杉中国选择与全球领先的基因测序平台因美纳合作发布一个智能医疗基因组学孵化器。未来十年的NGS市场,或许将因此而改变。
研究揭示人类衰老细胞空间基因组表观调控核心机制并绘制衰老相关染色质全局景观图谱
中国科学院上海营养与健康研究所研究员孙宇课题组经合作研究在Nature Aging上,在线发表题为KDM4 Orchestrates Epigenomic Remodeling of Senescent Cells and Potentiates the Senescence-Associated Secretory Ph
Cell DIVETM应用:基于空间蛋白组学建立结肠癌预后推断新方法
Cell DIVETM应用:基于空间蛋白组学建立结肠癌预后推断新方法张觉超 研究背景结直肠癌(Colorectal Cancer,CRC)是全球第三大癌症类型,占癌症相关死亡人数的第二位(图1)[2]。虽然CRC患者采用成熟的TNM分型进行分期和治疗,但肿瘤的异质性导致相同分型结肠癌患者的预后大相径庭。统计数据表明,相当比例的CRC患者术后1-2年
棉花生物学国家重点实验室研究团队揭示陆地棉地理分化和纤维品质改良的基因组学基础
陆地棉广泛种植于世界各地,是环境适应性最高的栽培棉种。棉花育种专家很早就发现陆地棉存在不同的生态型,然而对这些不同的生态型形成的机制却完全不了解。作为世界上最重要的天然纤维来源,陆地棉的纤维品质直接决定了其经济价值。解析陆地棉纤维品质形成的遗传基础可以为优质棉花生长改良提供理论信息。棉花生物学国家重点实验室杜雄明研究团队分析了超过30
Nature子刊揭示栽培陆地棉地理分化和纤维品质改良的基因组学基础
近日,中国农业科学院棉花研究所棉花资源创新利用创新团队主导完成了“栽培陆地棉地理分化和纤维品质改良的基因组学基础”研究,在国际上首次发现了远缘杂交对陆地棉纤维品质改良的关键分子证据,证实了远缘杂交在棉花育种中的重要意义,为进一步深入解析陆地棉的适应性演化和提升棉花纤维品质奠定了重要的理论基础。相关研究成果近日在线发表在《自然·遗传学(Nature Genet
蛋白质组学研究领域取得新进展
近年来,蛋白质相关数据海量增加,极大地促进了蛋白质组学的发展,高通量蛋白质组学数据挖掘研究已成为国内外生物信息学研究的热点和学科前沿。蛋白质的功能、代谢以及信号传导等生物过程都与其亚细胞定位密切相关,新合成的蛋白质必须处于合适的亚细胞位置才能正常行使其功能。而异常的蛋白质亚细胞位置能够影响蛋白质的功能,并与人类疾病息息相关,如阿尔兹海
Cell: 新型CRISPR转录组学编辑“机器”有助于重塑转录组记忆
基因编辑技术的进步大幅提升了我们修饰人类基因组的能力。基于sgRNA介导的CRISPR- Cas9相关基因编辑技术能够在指定位点引入DNA断裂以失活基因功能或通过同源性DNA修复引导精确的DNA编辑,这些技术已针对基础DNA序列的靶向变化进行了优化,因此非常适合修复或引入致病性突变。然而,上述技术对内源性DNA修复机制的依赖提出了挑战,因为这些途径的复杂性可能使其难以进一步提升精确性。
PNAS:“实时”转录组学揭示果蝇接种肿瘤细胞后的免疫防御机制
此前研究发现,通过将致癌的RasV12细胞注射到成年雄性果蝇中,会在经过几天的滞后期后大量繁殖,并导致2至3周后果蝇死亡。针对这一现象,来自法国斯特拉斯堡大学的Jules A. Hoffmann团队等人对细胞注射期间的转录组特征进行了研究。相关结果发表在最近的《PNAS》杂志上。