Pharmacological Research：小分子治疗功能代谢组学研究取得新进展
近日，著名药理学期刊Pharmacological Research在线发表上海交大吕海涛课题组与西安交大景王慧及王嗣岑课题组合作的最新研究成果“Dihydromyricetin improves DSS-induced colitis in mice via modulation of fecal bacteria-related bile acid me
elife：研究解析小鼠感觉运动相关脑区的转录组学特征
elife在线发表了中国科学院生物物理研究所研究员王晓群及其合作者题为Transcriptomic encoding of sensorimotor transformation in the midbrain的研究论文。研究人员利用逆向病毒示踪技术和Patch-seq单细胞转录组测序技术对小鼠上丘分别参与形成恐惧和捕食环路的神经元开
Oncogene：揭示胃肝样腺癌的基因组学特征和潜在治疗靶点
胃肝样腺癌（Hepatoid adenocarcinoma of the stomach， HAS）是临床上一种非常罕见，但恶性程度很高的胃部肿瘤。该肿瘤侵袭性极强，患者易出现肝脏和淋巴结的转移，患者预后极差。此肿瘤最早于1985年由日本学者所报道，因在组织形态学上能同时观察到胃腺癌及肝细胞肝癌特征故而得名。此外，此肿瘤高表达肝癌相关的分子标志物如AFP以及
Oncogene：揭示胃肝样腺癌的基因组学特征和潜在治疗靶点
胃肝样腺癌（Hepatoid adenocarcinoma of the stomach， HAS）是临床上一种非常罕见，但恶性程度很高的胃部肿瘤。该肿瘤侵袭性极强，患者易出现肝脏和淋巴结的转移，患者预后极差。此肿瘤最早于1985年由日本学者所报道，因在组织形态学上能同时观察到胃腺癌及肝细胞肝癌特征故而得名。此外，此肿瘤高
Cancer Res: 肿瘤相关成纤维细胞激活TGF-β信号决定肺腺癌的组织学特征
侵袭性肺腺癌(LADC)在组织学上可分为细毛型、腺泡型、乳头状型、微乳头状型或实性型。大多数LADC肿瘤表现出这些组织学亚型中的几种，异质性与治疗耐药有关。作者在此报道，在免疫缺陷小鼠中，人LADC细胞形成具有不同组织学特征的肿瘤，MUC5AC表达固体型或细胞角蛋白7(CK7)表达的腺泡型肿瘤，取决于发育部位，并且肿瘤微环境可以诱导固体到腺泡的转变(SAT)
Nature Communications：GapClust方法能够高效准确地从大量单细胞转录组中发现稀有细胞群体
近日，国际知名期刊《Nature Communications》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院俞章盛团队的研究成果“GapClust is a light-weight approach distinguishing rare cells from voluminous single cell expression profi
Genome Biology：开发出单细胞基因组单分子测序新方法
单细胞全基因组测序技术（scWGS）可以有效揭示生物样品中不同细胞之间的异质性，并系统鉴定单个细胞的基因组中发生的遗传变化，例如拷贝数变异（CNV）和点突变（单核苷酸变异，SNV）等。过去十年，研究人员已经开发出多种单细胞基因组扩增技术，例如简并寡核苷酸引物PCR扩增技术(DOP-PCR)、多重置换扩增技术（MDA）、多重退火和基于环的扩增循环技术（MALB
Genome Biology：科研人员开发出在单细胞中识别染色质类染色质拓扑相关结构域结构的算法
基因组DNA和组蛋白以特定的形式高度折叠在细胞核中，这一高级结构即三维基因组学，对细胞核内的诸多生命活动至关重要。基于染色质构象捕获（3C），尤其是高通量技术（Hi-C，ChIA-PET）的发展推动了三维基因组的研究，发现了包括染色质拓扑相关结构域（TAD），染色质环等一系列层次化的结构特征。近年来，单细胞水平下的Hi-C研究成为三维
铬污染场地土壤噬菌体组学研究取得进展
噬菌体（Bacteriophage）是专性捕食活体细菌或古细菌的病毒，其生化结构主要由蛋白衣壳和核酸组成，根据形态特点可划分为：有尾、短尾 (或球状) 和丝状噬菌体等。噬菌体长度通常在20~200 nm，在土壤、水、空气乃至人/动物体表、口腔、肠道内均有大量定殖。据估算，环境中噬菌体总数量级约为1031。针对养分胁迫、深海高压、极端气
Science：利用sci-Space技术在单细胞水平上揭示细胞基因转录的空间分布模式
2021年7月6日讯/生物谷BIOON/---一项名为sci-Space的新技术与来自其他技术的数据相结合，可能会在哺乳动物胚胎发育过程中，通过不同细胞的基因表达绘制出四维图谱。这类图谱将描绘出单个细胞中的基因转录本如何反映出时间的流逝、细胞谱系、细胞迁移以及发育中的胚胎位置。它们还将有助于阐明基因表达的空间调节。哺乳动物胚胎发育是一种了不起的现象：一个受精