科研人员开发基于分子网络特征整合单细胞数据的新方法
随着单细胞测序技术的快速发展,多个全球性的、大规模的细胞图谱项目相继启动,例如人类细胞图谱计划等。然而,把来自于不同组织、不同发育阶段或者只有很少重叠细胞类型的单细胞转录组数据集进行准确有效的整合仍然具有非常大的挑战性。因为当前整合单细胞数据的方法需要校正批次效应从而达到整合分析的目的,而上述所涉及的数据集的批次信息不清晰,利用这些方
Nature Communications:揭示多能干细胞维持基因组稳态新机制
多能干细胞是个体发育的基础,也是再生医学的重要种子细胞之一。由于发育地位特殊,多能干细胞基因组具高度稳态(如小鼠胚胎干细胞的基因组变异率仅为胚胎成纤维细胞的1/100)。尽管多能干细胞较分化细胞具更强的基因组稳态维持能力,大量扩增培养、持续的DNA复制及特殊的细胞周期往往导致基因组变异,破坏其分化潜能,并产生致瘤风险,成为
EMBO :利用单细胞测序解析人胚胎脊髓发育过程
脊髓是外周系统与大脑间信号传递的桥梁。脊髓背角介导着外周感受信号,而腹侧对于运动功能的执行至关重要,同时也是低级反射的中枢。作为一种高度有序的中枢组织,脊髓由多种不同的细胞类型有序发育形成。虽然脊髓的发育在啮齿类动物中已进行了一系列的研究,但对人类脊髓发育过程了解较少。中国科学院遗传与发育生物学研究所戴建武再生医学团队长期从事脊髓损伤
间质来源的细胞外囊泡mRNA标记表明前列腺癌的组织学性质
前列腺癌的组织学评估是关键的诊断试验,可以预测疾病的结局。然而,这是一种有创性的手术,具有相关的风险,因此非常需要非有创性的检测来支持诊断途径。疾病进展和随后的不良预后的一个关键特征是存在改变的基质。
Molecular Therapy Nucleic Acids: 长期培养对人骨髓间充质干细胞生物学特性和RNA谱的影响
在间充质干细胞(MSC)应用之前体外扩增是必要的过程。功能和基因组稳定性在基于干细胞的疗法中起关键作用。然而,在体外老化的人骨髓间充质干细胞(BM-MSCs)中,编码RNA和非编码RNA的确切表达和共表达谱尚不清楚。
Gastroenterology:研究通过单细胞基因组测序揭示肝细胞癌的双相拷贝数演化模型
胃肠病学领域学术期刊Gastroenterology以长文形式在线发表了北京大学第一医院肿瘤转化研究中心张宁课题组的研究成果。在题为“Single cell DNA sequencing reveals punctuated and gradual clonal evolution in hepatocellular carcinoma”的研究论文中,研究人
小野制药新型免疫肿瘤学疗法ONO-4685在美国进入1期临床:治疗T细胞淋巴瘤!
ONO-4685是一种在研的抗PD-1/CD3双特异性抗体,它与人类PD-1和CD3特异性结合,被开发用于治疗自身免疫性疾病和血液系统恶性肿瘤。
古人类基因组学研究发展的综述文章发表
中国科学院古脊椎动物与古人类研究所研究员付巧妹在Science特刊《人类基因组发布20周年》上,发表了题为Insights into human history from the first decade of ancient human genomics的综述文章,系统梳理了过去十余年来古人类基因组学研究的发展。二十世纪八十年代,通过获取的小的古DNA片段
Nature Communications:绘制川崎病单细胞免疫图谱
中国科学院上海营养与健康研究所、上海市儿童医院、上海国际人类表型组研究院等合作,完成了川崎病外周血单细胞免疫图谱的绘制工作。相关研究成果以Single-cell RNA sequencing of peripheral blood mononuclear cells from acute Kawasaki disease patients为题,在线发表在Na
Molecular Cancer: m6A调节因子在小细胞肺癌中的作用:分子特征、免疫肿瘤学特征和临床相关性
肺癌仍然是世界上最常见、最致命的癌症。小细胞肺癌(SCLC)是最致命的肺癌,约占肺癌总病例的15%。