Cell DIVETM应用：基于空间蛋白组学建立结肠癌预后推断新方法
Cell DIVETM应用：基于空间蛋白组学建立结肠癌预后推断新方法张觉超 研究背景结直肠癌（Colorectal Cancer，CRC）是全球第三大癌症类型，占癌症相关死亡人数的第二位（图1）[2]。虽然CRC患者采用成熟的TNM分型进行分期和治疗，但肿瘤的异质性导致相同分型结肠癌患者的预后大相径庭。统计数据表明，相当比例的CRC患者术后1-2年
棉花生物学国家重点实验室研究团队揭示陆地棉地理分化和纤维品质改良的基因组学基础
陆地棉广泛种植于世界各地，是环境适应性最高的栽培棉种。棉花育种专家很早就发现陆地棉存在不同的生态型，然而对这些不同的生态型形成的机制却完全不了解。作为世界上最重要的天然纤维来源，陆地棉的纤维品质直接决定了其经济价值。解析陆地棉纤维品质形成的遗传基础可以为优质棉花生长改良提供理论信息。棉花生物学国家重点实验室杜雄明研究团队分析了超过30
Nature子刊揭示栽培陆地棉地理分化和纤维品质改良的基因组学基础
近日，中国农业科学院棉花研究所棉花资源创新利用创新团队主导完成了“栽培陆地棉地理分化和纤维品质改良的基因组学基础”研究，在国际上首次发现了远缘杂交对陆地棉纤维品质改良的关键分子证据，证实了远缘杂交在棉花育种中的重要意义，为进一步深入解析陆地棉的适应性演化和提升棉花纤维品质奠定了重要的理论基础。相关研究成果近日在线发表在《自然·遗传学（Nature Genet
蛋白质组学研究领域取得新进展
近年来，蛋白质相关数据海量增加，极大地促进了蛋白质组学的发展，高通量蛋白质组学数据挖掘研究已成为国内外生物信息学研究的热点和学科前沿。蛋白质的功能、代谢以及信号传导等生物过程都与其亚细胞定位密切相关，新合成的蛋白质必须处于合适的亚细胞位置才能正常行使其功能。而异常的蛋白质亚细胞位置能够影响蛋白质的功能，并与人类疾病息息相关，如阿尔兹海
Cell: 新型CRISPR转录组学编辑“机器”有助于重塑转录组记忆
基因编辑技术的进步大幅提升了我们修饰人类基因组的能力。基于sgRNA介导的CRISPR- Cas9相关基因编辑技术能够在指定位点引入DNA断裂以失活基因功能或通过同源性DNA修复引导精确的DNA编辑，这些技术已针对基础DNA序列的靶向变化进行了优化，因此非常适合修复或引入致病性突变。然而，上述技术对内源性DNA修复机制的依赖提出了挑战，因为这些途径的复杂性可能使其难以进一步提升精确性。
PNAS:“实时”转录组学揭示果蝇接种肿瘤细胞后的免疫防御机制
此前研究发现，通过将致癌的RasV12细胞注射到成年雄性果蝇中，会在经过几天的滞后期后大量繁殖，并导致2至3周后果蝇死亡。针对这一现象，来自法国斯特拉斯堡大学的Jules A. Hoffmann团队等人对细胞注射期间的转录组特征进行了研究。相关结果发表在最近的《PNAS》杂志上。
研究揭示水稻根单细胞异质性和分化全景图
Nature Communications在线发表了中国科学院分子植物科学卓越创新中心研究员王佳伟研究组完成的研究论文Single-Cell Transcriptome Atlas and Chromatin Accessibility Landscape Reveal Differentiation Trajectories in
研究人员从单细胞水平揭示造血干细胞扩增的动态图谱
造血干细胞具有自我更新和分化的生物学特征，既可以维持其自身在造血组织中的恒定数量，又能向红系、粒系、巨核系和淋巴系等多种血细胞分化。造血干细胞移植广泛应用于白血病、再生障碍性贫血、骨髓增生异常综合征等临床血液系统恶性肿瘤的治疗，然而，造血干细胞来源不足，限制其广泛应用。因此，如何模拟体内造血干细胞扩增并实现临床转化应用备受关注。斑马鱼造血干/祖细胞（Hema
微生物功能代谢组学取得创新成果
微生物功能代谢产物的合成表达、转运和生物利用与许多重要生物学过程和事件密切相关，如微生物致病力的形成与表达、微生物感染机制、微生物生物膜的形成和微生物抗药性的产生等。系统生物学驱动的功能代谢组学方法，具有高灵敏、高分辨和高通量精准捕获和表征不同生物基质中功能代谢物的领先分析优势，是目前开展微生物代谢合成、代谢互作和代谢调控研究的强有力方法策略。该方法可以从精
Nature：揭示体细胞基因组编辑的发展机遇和挑战
2021年4月13日讯/生物谷BIOON/---遗传因素导致了大多数类型的人类疾病，包括遗传性疾病、传染性疾病和恶性疾病。因此，生物医学科学的一个长期目标是开发一种手段来修改患者体内的基因组，以校正致病突变，使入侵病原体的基因组失效，使免疫细胞攻击肿瘤，并使无数其他治疗机会得以实现。在某些情况下，基因添加可以具有治疗价值，而且基因疗法正在经历越来越多的成功。