Nature Methods :“等深度”模型重塑空间生物学格局!深度学习与空间转录组学的完美结合
GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法,创新性地提出了“等深度”(Isodepth)的概念。
2025-02-01
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。
2024-11-23
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
中国学者一作Cell论文:揭开人类如何感知甜味
这些研究结果揭示了人类甜味检测的结构基础,为单个甜味受体如何介导我们对如此广泛的甜味化合物的所有反应提供了见解,并为依据人类受体的结构设计新一代味觉调节剂开辟了独特的机会。
2025-05-09
Cancer Cell:复旦大学曹志伟/陈海泉团队绘制小细胞肺癌空间单细胞图谱,揭示其空间分子异质性及免疫互作生态位
该研究通过空间多组学揭示了非小细胞肺癌的肿瘤异质性和免疫微环境动态,提出了 MT2 生态位作为患者预后和免疫治疗响应的新标志,为小细胞肺癌的精准分型和治疗策略提供了重要依据。
2025-02-26
“碳标签”——活体感知软硬、酸碱与信号
研究人员开发出一种名为“碳标签”(CarboTag)的创新模块化工具箱。它是一个巧妙的小分子,能够像“导航仪”一样精准、快速地将各种探针分子靶向并结合到活体植物及藻类的细胞壁上,且对细胞毒性极低。
2025-05-05
Immunity:哈工大黄志伟团队揭示γδ T细胞感知磷酸抗原激活免疫反应的分子机制
这些研究结果共同揭示了配体诱导的 BTN 受体复合物由内而外的稳定化机制,从而实现 γδ TCR 的二聚体激活。
2025-05-09
Cell:王冰/李家洋团队揭示水稻中独脚金内酯信号感知机制
该研究成果阐明了水稻中由独脚金内酯受体D14介导的信号感知的激活、调控和终止机制,解决了独脚金内酯信号感知机制的争议问题,发现了在泛素化修饰和蛋白降解之间新的调控机制。
2024-11-10
研究揭示ZNFX1在病毒感知与炎症调控中的双重角色
本研究揭示了ZNFX1在病毒感知和炎症抑制中的双重作用,为治疗ZNFX1突变相关疾病提供了新的见解,即可能通过NLRP3炎症小体通路抑制剂来治疗该遗传疫病。
2024-11-08