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科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法

STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。

2024-11-10

Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性

利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。

2024-10-03

Cancer Cell:复旦大学曹志伟/陈海泉团队绘制小细胞肺癌空间单细胞图谱,揭示其空间分子异质性及免疫互作生态位

该研究通过空间多组学揭示了非小细胞肺癌的肿瘤异质性和免疫微环境动态,提出了 MT2 生态位作为患者预后和免疫治疗响应的新标志,为小细胞肺癌的精准分型和治疗策略提供了重要依据。

2025-02-25

Nat Method:单细胞分辨率下对细胞信号交流进行分析的多实例学习模型-Spacia

Spacia模型能够帮助研究者从各种生物学样品的单细胞空间转录组数据中获得新的知识。

2024-09-06

Nature Communications: 非小细胞肺癌的单细胞和空间转录组学分析

本研究综合数据集可以识别肺肿瘤微环境中巨噬细胞(Mɸ)群体的多种分子变化,这将有助于为制定治疗非小细胞肺癌的策略铺平道路。

2024-06-20

Cell:竺淑佳/李扬团队首次在原子分辨率上看清调控学习和记忆的“分子开关”NMDA受体的精细结构

研究团队提取了大鼠大脑皮层和海马中的内源 NMDA 受体并解析出了 3 种主要亚型及比例,揭示了内源 NMDA 受体的原子分辨率三维结构。

2025-01-26

清华大学杨茂君团队连续发文破译线粒体超大分子量多酶复合物的全景空间结构及组装机制

OADHc多年来一直是能量代谢领域内的研究热点之一。然而,由于该家族复合体的组成复杂、构象多变、且整体结构具有高度柔性,导致人们始终无法一窥其全貌。

2024-10-05

刘钢/黄丽萍/孙春萌团队开发用于超灵敏分子互作分析的小型微流控设备

该团队开发的NSCRE传感器与没有CRE效应的芯片相比,反射强度检测值提高了7.2倍。

2024-09-27

Science:开发出一种创新技术,可在单分子水平上分析复杂生物过程的动态变化

这种新开发的方法克服了单分子荧光显微镜领域的一个重大局限,而在此之前,由于一次分析一个样品较为费时费力,该领域一直受到低通量的限制。

2024-08-28