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王思远团队开发单分子分辨率、覆盖全基因组的空间转录组学新技术

该研究开发了 RAEFISH,这是一种基于图像的空间转录组学新方法,具有全基因组覆盖范围和完整组织中的单分子分辨率,从而解决了现有空间转录组学技术普遍存在的“鱼与熊掌不可兼得”的困境。

2025-10-05

Science:新研究开发出一种基于DNB阵列构建的空间分辨高通量单细胞转录组平台

Stereo-cell建立了一个具有空间和多模式能力的高通量单细胞转录组学整合框架。该平台克服了现有方法的关键限制,提高了分析细胞间相互作用、微环境和亚细胞基因表达的可扩展性、灵活性和精确度。

2025-08-26

Cancer Cell:黄活聪团队通过单细胞空间分析,揭示抗原呈递癌症相关成纤维细胞的“双重身份”及其空间生态位

该研究通过单细胞分辨率空间分析,揭示了抗原呈递癌症相关成纤维细胞(apCAF)包含了两个截然不同的亚群——间皮样 apCAF(M-apCAF),另一种是纤维细胞样 apCAF(F-apCAF)。

2025-10-01

Cell:空间组学终极方案?RAEFISH实现单分子与全基因组的“鱼与熊掌兼得”

RAEFISH及其衍生技术Perturb-RAEFISH的问世,不仅仅是为生命科学家的工具箱里增添了一件新工具,它更像是一种“范式转换”。

2025-10-07

Cancer Cell:复旦大学曹志伟/陈海泉团队绘制小细胞肺癌空间单细胞图谱,揭示其空间分子异质性及免疫互作生态位

该研究通过空间多组学揭示了非小细胞肺癌的肿瘤异质性和免疫微环境动态,提出了 MT2 生态位作为患者预后和免疫治疗响应的新标志,为小细胞肺癌的精准分型和治疗策略提供了重要依据。

2025-02-26

科研人员开发基于深度学习模型的空间转录组精细分辨率细胞注释算法

STASCAN提供了用于整合空间基因表达信息和组织学图像进行精细分辨率细胞注释的工具,在解码细胞空间精细分布和解析特异组织结构方面具有优势。

2024-11-10

Cell:竺淑佳/李扬团队首次在原子分辨率上看清调控学习和记忆的“分子开关”NMDA受体的精细结构

研究团队提取了大鼠大脑皮层和海马中的内源 NMDA 受体并解析出了 3 种主要亚型及比例,揭示了内源 NMDA 受体的原子分辨率三维结构。

2025-01-26