Cell:樊荣团队开发全球首个临床级福尔马林固定石蜡包埋(FFPE)样本的空间全转录组测序技术
在约2300种已知的人类成熟microRNA中,Patho-DBiT在MALT切片中检测到了1352种microRNA,其映射序列的长度峰值为21个核苷酸,与此类小RNA的已知长度完全一致。
Nature:中外科学家联手揭示结直肠癌的预后基因组和转录组特征
在这篇首次发表的研究论文中,研究者发现了将近100个发生突变的癌症驱动基因。其中,9 个是结直肠癌中的新型基因,24 个是任何癌症的新型基因。
Nature子刊:诸颖团队开发空间转录组语义注释新算法Pianno
在这项研究中,研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能,这些数据来自不同的空间技术平台。
科研人员描绘小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱
该研究利用高精度大视场时空组学Stereo-seq和单细胞转录组测序技术DNBelab C4,系统描绘了小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱。
Science:利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础
Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。
Journal of Advanced Research: 转录组关联研究为香榧仁油和脂肪酸的生物合成调控提供了新的思路
研究者构建了一个高完整性的基因组表达区参考序列。并对170个不同地方品种大田葵籽粒的10个脂肪酸和油脂性状进行了转录组参考关联研究(TRAS)。
研究揭示叶绿体延伸因子提高植物光合作用和抗病性的机制
该项研究经过10多年的持续探索,揭示了效应子Pi22926 抑制植物免疫应答的机制;以晚疫病菌效应子为探针,挖掘到同时调控植物光合作用和免疫的重要靶标基因。
Science:对发育中的人类大脑进行测序或能揭示成千上万种新型基因转录物
这项研究具有较强的治疗性意义,而且研究人员也能在临床上采取行动,而揭示新的转录物或能帮助在基因疗法试验中识别出新型疗法策略,并为携带罕见突变且与精神性或神经发育障碍相关的个体进行靶向性的临床试验。
Nat Commun | 叶海峰/管宁子:探索植物源光敏色素伴侣蛋白助力哺乳动物光开关转录调控
团队开发了一种光开关平台,能够实现基因转录的正交、模块化和可调控的控制,并将其整合到PTRC控制的CRISPRa系统(PTRCdcas)中,以调节内源基因的表达。
Cell:揭示生长中的细胞加快转录速度的机制
研究者发现,生长中的细胞之所以能产生所需的 RNA,是因为一种名为 RNA 聚合酶 II(RNAPII)的关键酶的可用性在不断增加,而这种酶的可用性会随着细胞大小的增加而增加。