Nature Methods ：“等深度”模型重塑空间生物学格局！深度学习与空间转录组学的完美结合
GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法，创新性地提出了“等深度”（Isodepth）的概念。
2025-02-01
Nature Methods：肿瘤进化的空间图谱：CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异（allele-specific CNAs）。
2024-11-23
Nature Methods：肿瘤进化的空间图谱，CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异，还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹，绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Cancer Cell：复旦大学曹志伟/陈海泉团队绘制小细胞肺癌空间单细胞图谱，揭示其空间分子异质性及免疫互作生态位
该研究通过空间多组学揭示了非小细胞肺癌的肿瘤异质性和免疫微环境动态，提出了 MT2 生态位作为患者预后和免疫治疗响应的新标志，为小细胞肺癌的精准分型和治疗策略提供了重要依据。
2025-02-26
北大校友一作Cell论文：让空间站“脏一些”，可以改善宇航员健康
这项研究提示我们，如果我们真的希望生命在地球之外繁荣发展，就不能只是把“生命之树的一个小枝条”发射到太空，然后指望它能成功。
2025-03-11
中国学者一作Nature论文：绘制转移性胰腺癌转录组可塑性空间图谱
不同患者的原发灶与其多器官转移灶之间缺乏统一的克隆进化模式，即使在同一器官内部，也可观察到多个独立克隆亚群的共存。此外，癌细胞的谱系表型与其克隆起源无严格对应性，而是显著地与其所处的肿瘤微环境相关联。
2025-04-27
我国学者首次在中国空间站发现微生物新物种，其已进化出适应极端太空环境的能力
该研究基于表型、生理生化特征以及基因组注释，表明发现于中国空间站的菌株 JL1B1071T 是尼尔菌属中的一个新物种，并建议命名为天宫尼尔菌（Niallia tiangongensis）新物种。
2025-05-19
安徽省立医院发表Nature论文：孙成/刘连新团队利用空间多组学+AI，开发出肝癌复发预测系统
该研究通过整合空间多组学数据和人工智能（AI）分析，提出了一个基于空间免疫特征的新型肝细胞癌（HCC）复发预测系统——TIMES（肿瘤免疫微环境空间评分系统）。
2025-03-15
大脑中的“园丁”与“杂草”Nature：利用空间转录组时钟揭示大脑衰老过程中的细胞邻近效应
这项研究表明，细胞之间的互动——而不仅仅是单个细胞的特性，在塑造衰老过程中起着关键作用。
2024-12-27