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Science:科学家开发出能帮助理解人类基因组中转录起始的特殊机器学习模型

研究人员开发了一种名为Puffin的机器学习程序,当分析了数以万计已知的人类启动子数据后,这种新型程序就能确定其由三种类型的序列模式所组成,即基序、启动子和三核苷酸(trinucleotides)。

2024-05-27

J Adv Res:IFP35通过促进nrf2调控的铁死亡加重金黄色葡萄球菌感染

本研究提示IFP35对SA感染引起的免疫病理有不良影响,铁死亡参与了sa诱导的病理过程,IFP35的缺失减少了sa介导的铁死亡。

2024-07-26

Cell:西湖大学解明岐/浙江大学邵佳伟等设计用于细胞智能计算的三态门基因表达调控系统

该研究首次提出的基因电路“三态门”设计原则(TriLoS)以及设计、构建的多种基因调控三态门,为细胞计算领域提供了理论指导和技术创新,解决了现有研究中只能通过经验来盲目设计和反复试错的设计模式。

2024-08-04

Science子刊:上海交大夏伟梁/陆舜团队揭示PTPRT缺失通过调控STING通路,增强抗PD-1疗法的肺癌治疗效果

研究团队通过转录组蛋白组测序、分子模拟和蛋白互作等实验阐明了分子机制:PTPRT 缺失型肿瘤表现出累积的 DNA 损伤、增加的胞质 DNA和更高的肿瘤突变负荷,间接激活STING通路。

2024-09-15

Nature子刊:武汉大学缪小平/田剑波团队绘制肿瘤微环境中免疫细胞遗传调控图谱并揭示其作用模式及早筛应用价值

这项研究明确了机体胚系遗传变异在肿瘤微环境异质性中的作用,提供了最全面的肿瘤免疫浸润遗传调控图谱。

2024-09-13

Cell Metab:初波/孙金鹏/于晓/柴人杰/徐云飞揭示GPR56感知17α-羟基孕烯醇酮调控铁死亡诱发的肝损伤

该研究团队阐明了类固醇代谢物17-OH PREG通过GPR56/ADGRG1途径抵抗铁死亡的新分子机制,并首次揭示了GPCR和相应的信号传导调控的铁死亡在临床治疗中的潜在重要作用。

2024-10-15

Nature:何川/徐明江团队阐明TET2酶通过氧化RNA m5C调控染色质状态和白血病发生

该研究发现表明,TET2介导的染色质相关RNA的m5C氧化,而非DNA氧化,在TET2缺失引发的转录激活和白血病发生中发挥着主导作用。

2024-10-06

Nature Aging:武汉大学伍兵团队揭示了年龄相关胸腺退化的机制——METTL3通过调控铁死亡影响胸腺细胞发育和胸腺退化

该研究揭示了年龄相关胸腺退化的调控机制——METTL3通过调控铁死亡影响胸腺细胞发育和胸腺退化,并进一步确定了恢复胸腺功能的潜在策略。

2024-11-10

Cell:揭示生长中的细胞加快转录速度的机制

研究者发现,生长中的细胞之所以能产生所需的 RNA,是因为一种名为 RNA 聚合酶 II(RNAPII)的关键酶的可用性在不断增加,而这种酶的可用性会随着细胞大小的增加而增加。

2024-02-29

Nat Immunol | 孙敏轩/李石洋/彭长庚等发现NPM1在炎症性肠病和结直肠癌中的调控作用

本研究揭示了NPM1通过结合p65促进TFAM转录、影响ILC3线粒体功能和IL22表达,从而参与肠道稳态调控的分子机制。

2024-08-09