Science:利用人工智能确定人类基因组转录起始的序列基础
Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。
2024-05-26
Nature子刊:转录因子TBX3的蛋白抑制再激活驱动BRAF/ mapk介导的肿瘤发生
本研究提供了令人信服的证据,表明TBX3在发展和肿瘤发生过程中受到泛素-蛋白酶体系统介质DUB USP15的调节。
2024-06-01
Nat Commun | 叶海峰/管宁子:探索植物源光敏色素伴侣蛋白助力哺乳动物光开关转录调控
团队开发了一种光开关平台,能够实现基因转录的正交、模块化和可调控的控制,并将其整合到PTRC控制的CRISPRa系统(PTRCdcas)中,以调节内源基因的表达。
2024-06-16
Nature:肠道菌群成致癌暴露物帮凶,促进癌症发生发展
该研究揭示了肠道菌群如何通过环境致癌物的代谢转化促进化学诱导的肿瘤发展,并加速远端器官组织的癌症进展,提示肠道菌群代谢可能是化学致癌的一个重要因素。
2024-09-01
PNAS丨厦门大学曹彬团队合作发现决定人类及小鼠胎盘滋养层细胞合体化的全新转录因子
该研究首次揭示转录因子TFEB在人类及小鼠胎盘滋养层细胞合体化过程中的保守性调控作用,阐明了mTORC1-TFEB-ERVFRD-1作用轴介导滋养层细胞融合的全新分子调控路径。
2024-07-16
科研人员描绘小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱
该研究利用高精度大视场时空组学Stereo-seq和单细胞转录组测序技术DNBelab C4,系统描绘了小鼠胆汁淤积损伤与再生的时空转录图谱。
2024-04-18
Cancer Res:转录因子BHLHE40是转移性结直肠癌EMT的驱动因素
来自南京医科大学第一附属医院普外科的研究者们在Cancer Res杂志上发表了题为“Cancer Res”的文章,该研究揭示了BHLHE40是调节上皮-间充质转化促进结直肠癌肝转移的关键转录因子。
2024-05-19
Nature子刊:诸颖团队开发空间转录组语义注释新算法Pianno
在这项研究中,研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能,这些数据来自不同的空间技术平台。
2024-04-10
Science:在怀孕期间和大量出血后,逆转录转座子激活造血干细胞,从而促进血细胞产生
研究发现,逆转录转座子和干扰素除了是避免贫血的必要条件外,还能在怀孕期间激活人类造血干细胞。
2024-10-28