Molecular Plant:关联分析方法学研究中取得突破性进展
华中农业大学植物科学技术学院章元明教授团队在植物学领域期刊Molecular Plant上发表了题为“A compressed variance component mixed model for detecting QTNs, and QTN-by-environment and QTN-by-QTN interactions in genom
Nucleic Acids Research:同济大学王晨飞团队开发空间转录组分析算法——STRIDE
近些年,高通量单细胞测序技术的发展,使得研究人员能够在单细胞分辨率研究复杂生物系统中细胞的异质性,但在实验过程中需要经历组织消化等操作,导致细胞在组织中原始位置信息的丢失。新兴的空间转录组学技术则在定量基因表达水平的同时,保留了细胞的空间信息,研究人员得以在空间背景下研究细胞不同的功能状态以及细胞间的相互作用。然而,由于技术的限制,目前大多数空间转录组或是检
Nat Neurosci:利用单核RNA测序技术来分析人类机体周围神经系统中的胶质细胞特征
来自华盛顿大学医学院等机构的科学家们通过研究深入理解了周围神经系统中不同的许旺细胞(schwann cells)的功能,即胶质细胞的功能。
Nucleic Acids Research:水稻非B型DNA二级结构的鉴定及功能分析方面取得新进展
近日,南京农业大学农学院张文利课题组在Nucleic Acids Research上发表了题为“Genome-wide characterization of i-motifs and their potential roles in the stability and evolution of transposable elemen
MGGM:通过分析精子样本或能帮助检测罕见的遗传突变
2022年2月20日 讯 /生物谷BIOON/ --新生变异是导致罕见智力障碍综合征的一种常见原因,其与较低的复发风险有关,然而,当这种突变体在亲本生殖细胞中出现时这种疾病的复发风险或许就会增加,目前对疾病复发风险的推测主要是基于经验性数据,而且生殖细胞嵌合的流行率往往是未知的。近日,一篇发表在国际杂志Molecular Genetics & Gen
PNAS:发表关于大脑网络动力学分析的最新研究成果
近日,上海交通大学自然科学研究院和数学科学学院的李松挺课题组利用微扰理论,揭示了大脑皮层中时间尺度层级化现象背后的数学机制和对应的生物学解释,研究成果“Hierarchical timescales in the neocortex: Mathematical mechanism and biological insights”在美国科学院院刊Proceed
Nat Genet:对2658份肿瘤样本进行分析揭示引起癌症的新型突变
来自Francis Crick研究所等机构的科学家们通过研究发现,21%的肿瘤都携带有双重突变,即你机体的DNA在母本和副本中都有完全相同的碱基发生了突变,这是此前在分析肿瘤时并未考虑到的观察结果,但对于未来癌症研究却非常重要,因为在癌症发生过程中,研究人员能够阐明突变的起源以及生物学意义。
科研人员提出新方法评估典范分析中解释变量的相对重要性
典范分析(canonical analysis)是生态学多元统计的核心分析方法,主要用于量化环境因子(解释变量)对多物种生物群落(响应变量)的决定作用。由于涉及参数较多,典范分析中的对具有多重共线性的解释变量的相对重要性评估是个尚未解决的难题。以往的分析使用简单效应(simple effect)、边际效应(marginal effec