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利用纳米孔测序研究人体组织样本等位基因效应对转录组结构的影响

 不同的组织和个体之间的基因表达和调控的差异很大,大部分的常见复杂性状相关的基因组通过假定表达和剪接机制来发挥作用,如10%的致病突变都具有已知的剪接效应,RNA测序则能够很好的分析等位基因特异性并解读遗传变异。迄今为止的大多数RNA测序研究都使用短读长RNA测序技术;由于短读长容易出现多重定位的情况,因此很难确定异构体的来源,同时会给定量带来干扰

2020-11-19

Cell:我国科学家揭示新冠病毒复制转录复合体的低温电镜结构

2020年11月17日讯/生物谷BIOON/---SARS-CoV-2 mRNA的转录需要由复制转录复合体(replication and transcription complex, RTC)促进的一系列反应。在一项新的研究中,来自中国清华大学、上海科技大学和武汉大学的研究人员展示了SARS-CoV-2 RTC向cap结构合成过渡时的结构快照。他们解析出由

2020-11-17

纳米孔测序技术在遗传病结构变异中的检测和应用

 遗传病是指由遗传物质发生改变而引起的或者是由致病基因所控制的疾病,具有先天性、终生性和家族性,且病种多,发病率高等特点,基因组变异主要分为SNV(单碱基变异)、Indel、结构变异(SVs)三大类。其中结构变异(SVs)通常指基因组上大的序列变化和位置关系变化,包括长度在50bp以上的长片段序列插入或者删除、串联重复、染色体倒位、染色体内部或染色

2020-11-15

PNAS:多层面揭示大脑结构

大脑的结构支持认知和行为功能,并且在相互影响的多层连接中极为复杂。但是,对于大脑结构的研究工作通常集中在单个空间尺度上。在由巴塞罗那大学复杂系统研究所(UBICS)的研究人员领导的研究中,研究人员研究了大脑的多尺度空间组织,并观察到,在几何网络模型中,不同分辨率的层是相似的,也就是说,随着我们移开,层的几何结构和连通性结构保持不变。

2020-11-05

研究揭示核纤层蛋白对人源细胞中染色质高级结构及染色质运动状态的调控

 细胞核内DNA完全展开长达2米,而一般细胞核的直径仅有10—20微米,因此基因组在细胞核内处于高度折叠的状态,同时不断发生运动变化。染色质的三维结构具有有序性和动态变化性,构成细胞核中各种生物学过程的全新调控层次。通过成像和高通量测序技术,研究者发现染色质高级结构分为染色质环(Loop)、拓扑关联域(Topologically associati

2020-11-17

Nucleic Acids Res:冠状病毒RNA结构预测潜在药物靶点

近日,格罗宁根大学,华沙国际分子与细胞生物学研究所和莱顿大学的研究人员详细研究了SARS-CoV-2冠状病毒RNA基因组结构。 RNA结构是开发抗病毒药物的潜在目标。结果于11月10日作为“突破性论文”发表在《Nuclear Acid Research》杂志上。

2020-11-12

研究揭示盐胁迫下产胞外多糖功能基因的差异表达特征及相关多糖结构属性

 盐碱化是干旱区农业面临的挑战,一些产胞外多糖的功能菌在特定条件下形成的胞外聚合物,能够通过螯合Na+、K+和 Ca+2等金属离子来缓解盐胁迫对植物的伤害,同时在一定程度上起到保持水分的作用,从而促进植物生长。在不同盐胁迫条件下,产胞外多糖功能菌在基因水平如何调控?其胞外多糖结构如何变化?针对上述问题,中国科学院新疆生态与地理研究所极端环境微生物研

2020-11-13

研究发现电离辐射引起核内染色质结构调控证据

 染色质是真核生命遗传物质DNA在细胞核内的存在形式,染色质根据细胞的活动状态和响应过程,如DNA复制、基因转录、DNA损伤响应和修复等,进行结构调节。染色质结构受电离辐射发生双链断裂(DSB)后的解聚现象已有报道,但是学界缺乏关于核内原位的染色质结构改变的证据支持,DNA发生双链断裂后,损伤响应和修复蛋白形成的修复聚合体亚结构图像亦不清楚。近日,

2020-11-05

通过结构化神经信息解码技术重建自然及人脸图像

 近日,中国科学院自动化研究所类脑智能研究中心神经计算与脑机交互团队的研究人员提出一种结构化神经解码模型,实现根据脑活动模式,进行自然图像、人脸等复杂视觉刺激的高质量重建。相关研究成果发表在IEEE Transactions on Neural Networks and Learning Systems上。长期以来,哲学家和科学家试图揣测、观察、理

2020-11-04

结构生物学领域研究进展

本期为大家带来的是结构生物学领域的最新研究进展,希望读者朋友们能够喜欢。

2020-10-29