Nature Methods :核苷酸转换模型(Nucleotide Transformer, NT)——解锁基因组预测的新纪元
该模型不仅能像阅读文本一样解读DNA序列,还能够预测基因组中的关键功能区域。
2024-12-12
Cell:转座子——基因组中的“垃圾”如何化身为免疫调控的利器?
IFNAR2-S的出现无疑是基因组进化的一次神来之笔,它不仅丰富了灵长类动物的免疫调控能力,也提醒我们:基因组中的“小插曲”,常常孕育着伟大的生物学创新。
2024-12-22
Cell:新研究表明细菌防御系统DdmDE有潜力用于基因组编辑
Fu团队实验的初步数据表明,DdmD切割质粒后剩余的质粒片段可以作为向导DNA片段,DdmE可以与之结合,从而重复执行这一过程。
2024-09-19
Nature:从基因组到公共卫生,Phylowave如何重塑病原体适应性监测
Phylowave不仅是一种技术创新,更是将基因组研究成果转化为公共卫生行动的桥梁。它的出现为应对新发传染病和提升全球健康安全提供了强大的科学工具。
2025-01-04
Science:颠覆传统基因组结构变异研究,Genome-Shuffle-seq的高效生成与精确检测
这项技术通过集成一类名为“Shuffle cassette”的基因组构件,将多个SV诱导事件以高通量的方式集成到细胞群体中,并能利用特定的条形码系统,在不同的细胞内追踪这些变异的发生与影响。
2025-02-05
Microbiome:科学家成功揭示机体免疫力和微生物组之间的神秘关联
研究者表示,微生物组的改变与不同的代谢组谱相关,这些差异会受到胃肠道表现的影响,并能通过基于某些免疫调节剂的疗法来部分逆转。
2025-02-26
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。
2024-11-23
Nature子刊:叶海峰团队开发新型光遗传学技术,实现光照减肥!
REDLIP是一套无需外源添加色素、灵敏性高(< 10s)、诱导效率高(> 100倍)且具有生物兼容性好和组织穿透力强的新型光遗传学工具。
2024-12-07
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10