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Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性

利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。

2024-10-03

Science:利用人工智能确定人类基因转录起始的序列基础

Puffin程序显示,根据这些序列模式的排列方式,它们可以激活或抑制基因的转录。它还能预测这些序列模式的排列如何引导 RNA 聚合酶优先转录 DNA 的单链或同时向相反方向转录两条链。

2024-05-26

​Nature子刊:浙江大学孙会增/王永成团队开发微生物单细胞转录学技术,揭示奶牛瘤胃微生物活性功能类群

该研究利用MscT技术,通过基于BGMGM的泛基因组功能基因比对策略,揭示了瘤胃微生物生态系统原位活性代谢功能类群。

2024-06-16

Science:剪接体对RNA转录本的编辑延迟会导致细胞死亡

在这项新的研究中,这些作者如今发现了一种以更微妙的方式干扰剪接过程的机制。它与剪接体的一个由三种亚基U4、U5 和 U6组成的特定部分有关。

2024-11-28

研究揭示我国被子植物灭绝风险的空间格局及驱动因素

该研究首次展示了我国被子植物灭绝风险的空间聚集性和驱动因素的尺度依赖性,强调了生物多样性保护的复杂性和紧迫性,对于理解我国被子植物灭绝风险现状、预测生物多样性丧失趋势并制定针对性保护措施具有科学价值。

2024-08-02

Cancer Cell丨毛开睿团队空间解析肿瘤抑制性免疫微环境

这项研究揭示了肿瘤抑制性免疫微环境的空间组织结构、驱动其形成的分子机制及其相应的生理功能。

2024-07-20

空间学技术破译阿尔茨海默病的重要风险因子!Mol Psych:首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析

此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑,使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。

2024-08-14

Nature:转录与翻译的协奏曲!揭示基因表达耦合的新调控模式

研究人员首次在实验室中重建了完整的转录-翻译偶联系统,并利用多色单分子荧光显微镜技术,实时追踪了转录延伸、翻译延伸以及两者之间的耦合。

2024-12-13

大学池塘中的神奇生物,基因转录规则“与众不同”

DNA就像建筑物的蓝图,它本身不做任何事情但下达必要的指令。为了让基因产生影响,必须先读取DNA,再将其构建成具有物理效应的分子。

2024-07-15

Clin Mol Hepatol:肝硬化相关并发症的肠道微生物和代谢特征

本研究扩大了针对特定肝硬化相关并发症的肝硬化生物标志物的范围,还强调了肝硬化患者粪便微生物和代谢指标下降的相关性,这些指标与MELD和CTP评分以及AST、ALT、胆红素等临床指标密切相关。

2024-09-29