研究提出准确识别基因组间直系同源共线性的新方法
中国科学院昆明植物研究所研究员马永鹏团队联合国际、国内科研机构开发了直系同源指数(OI),以度量共线性的直系同源水平,其定义为种间共线性区块内直系同源基因的占比。
2025-05-02
Nat Cell Biol:单细胞新RNA测序在单次转录爆发层面上揭示了转录原理
通过改进的单细胞新RNA测序技术(NASC-seq2),研究深入揭示了转录爆发的动力学原理,发现了合成率在决定转录爆发规模中的关键作用。
2024-09-26
Sci Adv:四川大学张韵秋等团队研究揭示了空间有序的牙源性干细胞在哺乳动物出生后矿化器官发育中的关键作用
该研究发现,出生后磨牙的形成受一个空间有序的Cd24a+/Pax9+祖细胞核心调控,该细胞群可维持至成年阶段。
2025-06-15
Nature Genetics | 揭示肺纤维化新视界:从小鼠到人的空间转录组学描绘特发性肺纤维化(IPF)病理机制
该研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,详细描绘了IPF和小鼠肺纤维化模型中的细胞相互作用和信号传导途径,揭示了关键的趋同和分歧路径。
2024-07-04
科学家破译枸杞子基因组图谱
该研究基于三代测序技术、光学图谱技术、自研高效三维基因组捕获技术等方法,对枸杞进行de novo的基因组组装,突破枸杞基因组高杂合、高重复的瓶颈,获得枸杞高精度基因组图谱。
2024-12-31
迄今最精细黑猩猩脑图谱——黑猩猩脑网络组图谱发布
近期,中国科学院自动化研究所脑网络组研究团队联合国内外科研机构,发布了迄今为止最精细的黑猩猩脑图谱。这一成果为比较神经科学研究提供了重要工具,并为探讨人脑演化提供了新视角。
2025-01-31
Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性
利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。
2024-10-03