单细胞和空间转录组中环形RNA深度学习算法取得进展
CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。
2024-02-21
Nat Neurosci:绘制出首张全面RNA异构体图谱,揭示神经多样性与疾病奥秘
这项研究通过绘制发育阶段、解剖区域与物种间全长度异构体调控的单细胞精细图谱,深度揭示了异构体变异在多维度上的广泛存在与深远影响。
2024-04-29
李程/孙育杰/黄粤团队揭示异倍体对染色质空间结构和转录组的影响
本研究结合Hi-C、RNA-seq、染色体成像和新生RNA成像技术,探究了异倍体ESC相比正常二倍体ESC在染色质三维结构和基因转录层面的变化。
2024-04-12
Nat Cell Biol丨蓝勋和孟安明合作开发高通量、低成本SPATAC-seq技术并绘制斑马鱼早期胚胎发育染色质可及性图谱
SPATAC-seq是一种基于单细胞组合索引(Single-cell combinatorial indexing)原理设计开发的单细胞染色质可及性技术。
2024-07-16
首次绘制出酵母基因组编码蛋白在完整细胞周期中的精密运动与分布图谱
酵母作为真核生物的理想模型,其独特优势在于能够让我们观测到大规模的生物学过程,这是在其他更简单或更复杂的生物体中难以实现的。通过研究酵母细胞周期,有望深化对人类细胞周期机制的理解。
2024-05-02
Nature:中外科学家构建出迄今为止最全面的人类衰老骨骼肌的单细胞图谱
肌肉可以自我修复。这主要是由肌肉干细胞完成的,它们在受伤后开始增殖并分化成肌肉细胞,所产生的肌肉细胞相互融合或与现有肌纤维融合,以修复受损肌肉。
2024-04-28
Science:科学家解锁人脑微观宇宙,新型人类大脑图谱包含此前从未见过的详细结构细节
研究人员通过联合研究创建了迄今为止最大的突触分辨率、人类大脑的3D重建结构,从而生动详细地展示了仅有半个米粒大小的人类颞叶皮层中每个细胞及其神经连接网络的细节信息。
2024-05-20
Nat Genet:科学家开发出能对人类自身免疫性疾病进行遗传图谱绘制的新型统计学方法—SCENT
本文研究结果表明,将SCENT方法应用于来自疾病相关人类组织的多模态数据中,或许就能扩展构建准确的细胞类型特异性的增强子-基因图谱,这对于定义非编码的突变功能至关重要。
2024-04-22