Nature Methods：肿瘤进化的空间图谱：CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异（allele-specific CNAs）。
2024-11-23
Nature Methods：肿瘤进化的空间图谱，CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异，还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹，绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Nat Cancer：王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱，揭示肝细胞癌微环境空间异质性
利用CODEX技术，研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色，分辨率达0.377 μm/pixel，一共获得了4,347,731个细胞，定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。
2024-10-03
Nature：首次构建出人类胸腺细胞空间图谱，揭示人体免疫反应如何在生命早期建立和维持
这项研究的一项重要成果是开发了一种名为OrganAxis的标准化高分辨率空间绘图方法，用于比较胸腺样本在不同发育阶段的组成和结构组织，其分辨率比以往任何时候都要高得多。
2024-11-26
迄今最精细黑猩猩脑图谱——黑猩猩脑网络组图谱发布
近期，中国科学院自动化研究所脑网络组研究团队联合国内外科研机构，发布了迄今为止最精细的黑猩猩脑图谱。这一成果为比较神经科学研究提供了重要工具，并为探讨人脑演化提供了新视角。
2025-01-31
Nature Methods ：“等深度”模型重塑空间生物学格局！深度学习与空间转录组学的完美结合
GASTON通过结合无监督的深度神经网络与可解释性算法，创新性地提出了“等深度”（Isodepth）的概念。
2025-02-01
科学家破译枸杞子基因组图谱
该研究基于三代测序技术、光学图谱技术、自研高效三维基因组捕获技术等方法，对枸杞进行de novo的基因组组装，突破枸杞基因组高杂合、高重复的瓶颈，获得枸杞高精度基因组图谱。
2024-12-31
Nature：成功构建出人类DNA非交叉重组图谱
所有人类遗传多样性都可以追溯到重组和从头突变，即存在于孩子身上但不存在于父母身上的DNA序列。该图谱显示，突变在DNA混合的区域附近升高，因此这两个过程高度相关。
2025-02-12
Cell：新研究构建出肠道细胞的空间图谱，并在肠道炎症过程中追踪它们的轨迹
在以前的研究中，IAF已在癌症和自身免疫性疾病等多种疾病中观察到，因此了解IAF的作用和机制可能有助于开发治疗这些疾病的方法。
2024-04-22