Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱:CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的核心优势在于其能够从SRT数据中精确推断等位基因特异性拷贝数变异(allele-specific CNAs)。
2024-11-27
Nature Methods:肿瘤进化的空间图谱,CalicoST算法揭示癌症克隆的基因组与空间演化
CalicoST算法的诞生填补了这一空白。它不仅能够从空间转录组数据中推断出肿瘤的等位基因特异性拷贝数变异,还能够重建肿瘤克隆在空间中的进化轨迹,绘制出肿瘤演化的“进化地图”。
2024-11-10
Nat Cancer:王红阳/陈磊团队绘制肝细胞癌单细胞分辨率空间原位蛋白图谱,揭示肝细胞癌微环境空间异质性
利用CODEX技术,研究人员对401名HCC患者的肿瘤样本进行36种抗体染色,分辨率达0.377 μm/pixel,一共获得了4,347,731个细胞,定义了72个细胞表型以及40个细胞邻域关系。
2024-10-03
Cell:新研究构建出肠道细胞的空间图谱,并在肠道炎症过程中追踪它们的轨迹
在以前的研究中,IAF已在癌症和自身免疫性疾病等多种疾病中观察到,因此了解IAF的作用和机制可能有助于开发治疗这些疾病的方法。
2024-04-22
空间组学数据解析肿瘤微环境的异质图学习方法
该研究提出了名为stKeep的新模型。该模型构建了三种不同节点即细胞/spot、基因和肿瘤区域以及八种连接关系的异构图模型,用于刻画肿瘤微环境。
2024-07-02
研究揭示我国被子植物灭绝风险的空间格局及驱动因素
该研究首次展示了我国被子植物灭绝风险的空间聚集性和驱动因素的尺度依赖性,强调了生物多样性保护的复杂性和紧迫性,对于理解我国被子植物灭绝风险现状、预测生物多样性丧失趋势并制定针对性保护措施具有科学价值。
2024-08-02
Nature Communications: 非小细胞肺癌的单细胞和空间转录组学分析
本研究综合数据集可以识别肺肿瘤微环境中巨噬细胞(Mɸ)群体的多种分子变化,这将有助于为制定治疗非小细胞肺癌的策略铺平道路。
2024-06-20
墨卓生物携手行业先锋,共绘单细胞空间组学技术发展蓝图
本次研讨会不仅为参会者提供了一个高质量的产学研医深入交流和探讨的平台,更在推动单细胞与空间组学前沿及其在生命科学领域的转化应用等方面,起到了重要的促进作用。
2024-09-13
Science:新研究构建出全面的哺乳动物早期形态发生图谱
这些研究结果详细揭示了哺乳动物胚胎的发育如何受可变性和稳健性的支配。没有混乱,就没有结构;二者缺一不可。这两者都是构成‘正常’发育的重要组成部分。
2024-10-16