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Cell:开发出一种称为 Open-ST 的空间转录学平台,能够三维重建组织内细胞中的基因表达

Open-ST 提供了一种高性价比、高分辨率、易于使用的方法,可同时捕捉组织切片的组织形态和空间转录组学信息。连续的二维图谱可以对齐,可将组织重建为三维“虚拟组织块”。

2024-07-15

空间学技术破译阿尔茨海默病的重要风险因子!Mol Psych:首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析

此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑,使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。

2024-08-14

​Nature子刊:浙江大学孙会增/王永成团队开发微生物单细胞转录学技术,揭示奶牛瘤胃微生物活性功能类群

该研究利用MscT技术,通过基于BGMGM的泛基因组功能基因比对策略,揭示了瘤胃微生物生态系统原位活性代谢功能类群。

2024-06-16

单细胞空间转录中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21

Nature Genetics | 揭示肺纤维化新视界:从小鼠到人的空间转录学描绘特发性肺纤维化(IPF)病理机制

该研究通过空间转录组学和单细胞RNA测序技术,详细描绘了IPF和小鼠肺纤维化模型中的细胞相互作用和信号传导途径,揭示了关键的趋同和分歧路径。

2024-07-04

Nature:重庆大学印明柱团队绘制迄今最大规模泛癌种脉管系统单细胞图谱,揭示肿瘤血管生成的复杂过程

这项研究描绘了肿瘤血管系统的复杂性,为充分理解肿瘤血管生成的复杂过程提供了全景视角,对抗血管生成治疗具有潜在临床意义。

2024-07-15

Nature子刊:诸颖团队开发空间转录语义注释新算法Pianno

在这项研究中,研究团队展示了Pianno在注释各种形状的解剖结构以及病灶和细胞类型方面的卓越性能,这些数据来自不同的空间技术平台。

2024-04-10

Nature Methods | 何爱彬/舒绍坤团队合作开发单细胞药物基因靶点检测新技术解析表观耐药机制

scEpiChem提供了一个全面的高通量分析框架,捕捉了传统bulk分析无法实现的小分子药物反应的细胞异质性特征。

2024-07-20

Cell:新研究构建出肠道细胞空间图谱,并在肠道炎症过程中追踪它们的轨迹

在以前的研究中,IAF已在癌症和自身免疫性疾病等多种疾病中观察到,因此了解IAF的作用和机制可能有助于开发治疗这些疾病的方法。

2024-04-22