Nature:科学家建立迄今为止最大规模肾脏多维单细胞图谱,能预测患者五年之后的肾功能状况
这是目前为止规模最大的人体肾脏单细胞研究,获得了迄今为止最全面的人体肾脏单细胞数据,建立了第一个人类肾脏的多维单细胞参考图谱。
华大智造发布两款单细胞组学新品,助力单细胞多组学标准化、规模化发展
未来,华大智造将进一步深耕单细胞组学领域,发挥自身在基因测序设备领域、实验室自动化领域的优势,为规模化的科学研究、为单细胞组学全面进入临床及精准健康研究,提供更为优质、标准的系列产品组合
Nat Microbiol:利用完整HCMV病毒颗粒的空间蛋白图谱揭示疱疹病毒HCMV如何欺骗人类宿主细胞
疱疹病毒非常狡猾:一旦感染,就永远无法摆脱它。这是因为疱疹病毒会终生潜伏在人体内的某些宿主细胞中。几乎每个成年人都在不知不觉中携带了九种不同的人类疱疹病毒中的至少一种。由于年龄、压力或免疫系统减弱,疱
Advanced Science:韩敬东团队开发转录组数据空间重构新算法
该研究建立了一种单细胞/寡细胞转录组数据从头空间重构算法——De Novo Coalescent Embedding(D-CE)。该研究利用细胞-细胞转录相关网络的非线性嵌入方法,从头重构了单细胞转录
Nature Cancer:汪希鹏/张泽民/李子逸等绘制卵巢癌多组织单细胞分辨率图谱
该研究指出腹水中记忆T细胞对肿瘤原发灶及网膜转移灶免疫微环境的关键重塑作用,并揭示了肿瘤组织和腹水中巨噬细胞功能表型和发育起源的异质性,为深入理解卵巢癌进展中恶性腹水的关键作用以及探索靶向肿瘤腹水的免
空间转录组数据多模态可视化工具研究取得进展
目前已有工具可以将二维切片的基因表达模式进行可视化,或者进一步堆叠多张切片并形成组织的三维静态视图,但在三维空间中对空间转录组数据的分子特征和空间形态进行交互式探索仍然是一个难点。
单细胞转录组测序,揭示动物发育过程“古老”和“年轻”基因的表达模式
这一研究揭示了不同细胞类型在转录组年龄上的显著差异,有助于对不同细胞的进化起源进行估计,为理解驱动物种进化的遗传机制提供了新的视角
迄今最大规模研究破解持久性CAR-T细胞转录组特征
Ghorashian团队认为,他们这个研究最重要的发现是发现了持久性CAR-T细胞的独特转录特征。而且这个特征在不同人群、不同CAR-T疗法中也存在。因此这暗示着,这种独特的转录特征有可能代表了持久性
单细胞多组学技术揭示三维基因组与基因表达的关系
在高等真核生物中,基因组在细胞核内的三维空间构象对细胞功能至关重要。例如,增强子常常通过三维空间相互作用对远端目的基因的转录活性起调控作用
Nature子刊:李婧翌团队开发用于单细胞多组学和空间组学的数据模拟和统计推断的多功能模拟器scDesign3
总的来说,scDesign3是一个多功能套件,用于基准测试计算方法和解释单细胞和空间组学数据。