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Nat Commun:通过整合细胞形态空间转录深度剖析肿瘤生态系统

METI是一种机器学习方法,它通过整合空间基因表达数据和病理学组织学特征,系统性地分析肿瘤生态系统。

2024-09-04

Nature子刊:人工智能+血浆蛋白质,提前7年预测帕金森病

在这项研究中,研究团队分析了99名近期被诊断患有帕金森病的患者、72名出现快速眼动睡眠行为障碍但还没有出现帕金森相关运动症状的患者,以及36名健康对照者的血样。

2024-06-25

EMBO J:揭示TRP14是细胞内半胱氨酸还原的限速酶,调节蛋白质半胱氨酸化

长期以来,TRP14一直没有明确的功能。本项研究不仅明确了它在半胱氨酸代谢中的作用,还有助于解释它在不同物种间的进化保守性。

2024-07-08

Nat Aging:揭示小鼠大脑内皮细胞蛋白质随着年龄的增长而变化

研究结果表明,参与细胞摄取物质、受体再循环以及在称为溶酶体的特定细胞区室内降解分子的关键分子出现了失调。

2024-04-03

Nature Biotechnology | 突破质谱细胞术的瓶颈:ACE技术助力低丰度蛋白质检测

质谱细胞术(Mass Cytometry)是一种通过使用金属同位素标记的抗体来标记感兴趣目标的技术,能够在单细胞水平上同时测量数百万个细胞中的大约50种蛋白质或蛋白质修饰。

2024-08-05

Nat Chem Biol : 魏文胜团队实现蛋白质中丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸位点的功能解析

氨基酸是组成蛋白质的基本单位,其突变可以通过多种方式影响蛋白质功能,进而影响细胞生存和多种疾病的发生发展。此前研究已证明,使用碱基编辑器进行内源性氨基酸替换,并结合细胞筛选来大规模研究其功能的可行性

2024-10-09

Cell:微胶质细胞衍生的C1q调控衰老大脑蛋白质稳态的新机制

这一系列实验结果共同证明了C1q在衰老大脑中的新功能,并突显了微胶质细胞和补体蛋白在神经元功能和认知健康中的重要性。

2024-08-23

空间技术破译阿尔茨海默病的重要风险因子!Mol Psych:首次实现在单细胞水平上对TREM2 R47H遗传变异影响的深度解析

此项研究首次以如此精细的尺度全面审视大脑,使得研究者能更深入理解TREM2 R47H突变对特定细胞类型中基因表达的影响。

2024-08-14

解锁细胞分化的“秘密武器”!Nat Commun:LSD1既能去除组蛋白上的“标签”,又能为其他蛋白质提供支撑

本文研究阐明了LSD1控制小鼠胚胎干细胞中DNA甲基化的分子机制,这并不依赖于其赖氨酸去甲基化酶的活性。

2024-10-18

单细胞空间转录中环形RNA深度学习算法取得进展

CIRI-deep可以实现多种转录组测序数据中差异剪接环形RNA的可靠预测,并在单细胞及空间水平实现细胞类型特异环形RNA的准确解析,具有广泛的应用场景。

2024-02-21