Genome Biology：基于零膨胀概率主成分分析模型的微生物组数据去噪新方法mbDenoise
该研究提出基于零膨胀概率主成分分析的统计模型和变分近似算法对微生物组数据进行去噪，对揭示微生物组数据潜在的生物学信号有重要意义。
有望作为新的基因编辑和核酸检测工具
像人类一样，细菌有多种免疫系统来抵御病毒等病原体。这些免疫系统通常降解病原体的DNA以使其变得无害。在一项新的研究中，来自荷兰瓦赫宁根大学和代尔夫特理工大学的研究人员在细菌中发现一种全新的利用一种不同
Nature:科学家构建基因表达调控DNA序列进化和适应度景观研究框架
顺式作用元件是位于基因旁侧序列中能影响基因表达的非编码DNA序列。这些顺式作用元件的突变可能影响与基因转录因子相互作用，从而调控基因表达，进而改变生物表型和适应度景观。一个完整的适应度景观由一个适应度函数定义，该函数将序列空间中的每个序列映射到其相关的适应度。但调控DNA序列与适应度建立的映射关系很难可靠地推广到整个序列空间，因此构建完全的适应度
北航常凌乾课题组开发活细胞核蛋白和迁移行为综合分析生物芯片
作者将40个标记点定义为四个部分，从细胞内探测区域的边缘（起点）到微通道的静脉孔，每十个标记点设为一组间隔。课题选择与细胞迁移率相关的MDM2蛋白作为检测蛋白，其表达水平与细胞迁移速度呈正相关。
Science：对癌症中体细胞非编码突变模式的全基因组分析
肿瘤产生的一个关键标志是癌细胞在其基因组中获得了正常组织中不存在的体细胞突变。一些突变是驱动突变（driver mutation），有助于肿瘤细胞生长，但其他许多突变是乘客突变（passenger m
微生物领域数据库及其分析系统建设研究取得进展
微生物领域数据库及其分析系统建设方面取得新进展，提出了一种利用语义网技术构建知识图谱的方法，可将冠状病毒相关的毒株、基因组、蛋白序列、蛋白结构、抗体、文献和专利等多源异构数据映射至资源描述框架。
香港更新新冠病死分析，Omicron毒力和疫苗有效性真相大白
2022年4月7日，中国香港特别行政区卫生署公布的新冠疫情显示，过去24小时新呈报病例数分别为：经核酸检测1368例，快速抗原检测1276例；病死97例【1】。香港新增病例数和死亡病例数均持续下降。
Nature Machine Intelligence：发现基于Transformer的多肽-HLA I类结合预测和疫苗的新生抗原序列设计
近日，国际知名期刊《Nature Machine Intelligence》在线发表了上海交通大学生命科学技术学院魏冬青团队的研究论文《A transformer-based model to predict peptide–HLA class I binding and optimize mutated peptides for v