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Nature Methods :核苷酸转换模型(Nucleotide Transformer, NT)——解锁基因组预测的新纪元

该模型不仅能像阅读文本一样解读DNA序列,还能够预测基因组中的关键功能区域。

2024-12-12

研究揭示黄酮类物质合成新基因簇帮助荞麦属植物适应高海拔

研究团队通过全基因组关联分析发现,苦荞1号染色体上葡萄糖基转移酶基因启动子区域的基因变异与多种黄酮类物质含量密切相关。

2024-10-13

研究人员构建SAM关键homeobox基因调控网络解析玉米株高发育的分子机制

为构建组织特异性动态调控网络,基于黄化幼苗叶片ATAC-seq和tsCUT&Tag数据,团队设计并训练了一个机器学习模型,以预测SAM组织的调控位点。

2024-10-12

Mol Cell:揭示RNA在调节癌细胞中基因表达上所扮演的关键角色

本文研究结果为阐明RNA和TOP1在调节RNAPII依赖性转录所固有的DNA拓扑异构压力中的协调作用提供了新的见解。

2024-09-04

科学家们发现能控制基因活性的新型遗传代码!

研究者发现,转录因子之间的间隔和其相对于基因转录开始的位置或许决定了基因活性的水平。

2024-09-03

Nature重磅:首次在活体动物中实现对肠道细菌的原位、精准基因编辑

研究证明了直接在活体动物肠道中对细菌进行精准基因编辑的可行性,为研究细菌基因的功能提供了新途径,并为设计新的微生物组靶向疗法打开了大门。

2024-07-13

Science:利用人类线粒体mRNA结构组揭示人类线粒体中的基因表达机制

来自迈阿密大学和哈佛医学院的研究人员在一项新的研究中改进了一种利用硫酸二甲酯(DMS)对 mRNA 结构进行化学探测的方法,其中硫酸二甲酯可将腺嘌呤和胞嘧啶未配对且可触及的碱基配对面甲基化。

2024-07-27

Nat Genet:新研究绘制出关键癌症基因VHL所有潜在变异的影响图谱

在这项新的研究中,这些作者使用了一种名为饱和基因组编辑(saturation genome editing)的新方法,随着时间的推移,对人类细胞中2000多种不同VHL变异的功能进行了长期跟踪。

2024-07-10

Nat Commun:科学家识别出治疗人类糖尿病肾病的新型基因疗法靶点

本文研究结果为指导未来研究从而阐明人类糖尿病肾病发生的特殊肾脏信号通路和潜在治疗性靶点提供了丰富的数据资源。

2024-12-28

Nat Genet:新研究发现AFF3基因的GCC重复序列扩增与人类智力残疾有关

这项研究的全表型组关联方法(phenome-wide association approach)将基因变异与人类表型联系起来,强调了这些基因变异对公共健康的广泛影响。

2024-09-25