Nature Communications：研究发表单细胞转录组数据检索新方法和参考数据库
作为细胞异质性研究的重要工具，单细胞转录组测序技术近年来蓬勃发展，并积累了大量研究数据。若能有效利用现有的单细胞数据进行检索与推断，研究者便能更好地进行新测序单细胞的注释，以及综合多数据集的研究。然而，精确的单细胞转录组数据检索和注释需要克服两个挑战：一、数据集之间的批次效应（batch effect）会显着影响细胞检索的可靠性；二、目前缺少跨物
Nat Biotechnol：科学家发现能准确高效进行单细胞转录组特性分析的最佳技术—Quartz-seq2
2020年4月9日 讯 /生物谷BIOON/ --为了确保单细胞RNA测序能够使用最好的方法，日前研究人员对13种方法进行了基准性的测试，一项刊登在国际杂志Nature Biotechnology上的研究报告中，来自西班牙的科学家们通过研究发现，日本理化所开发的Quartz-seq2方法或许是进行单细胞RNA测序的最佳手段。图片来源：CC0 Public D
研究开发单细胞空间转录组数据分析可视化平台
单细胞测序技术是一种在单细胞水平上对基因组、转录组、表观组等进行高通量测序分析的技术。单细胞测序技术能够在组学水平揭示细胞间的异质性。单细胞水平细胞谱系追踪技术位居2018年Science 杂志评选的十大科学突破之首。常规单细胞转录组测序技术丢失了细胞在原组织中至关重要的空间位置信息，而单细胞空间转录组技术在进行单细胞转录组测序的同时保留并记录了细胞的空间位置信息。空间转录组技术能够揭示细胞间的相
白血病细胞或会通过表观遗传学改变转分化为非癌变细胞！
2019年11月18日 讯 /生物谷BIOON/ --日前，一项刊登在国际杂志Leukemia上的研究报告中，来自Josep Carreras白血病研究所等机构的科学家们通过研究发现，白血病细胞或能通过表观遗传学改变转化称为非癌变细胞。图片来源：Manel Esteller我们机体的所有组织都携带相同的DNA，但其却会发挥不同的功能，比如，淋巴细胞和神经元就拥有相同的遗传物质，但其却履行着不同的任
Science：利用单细胞基因组学进行人类细胞表型分析
2019年10月20日讯/生物谷BIOON/---在一篇近期发表在Science期刊上的标题为“Mapping human cell phenotypes to genotypes with single-cell genomics”的综述类型文章中，瑞士研究人员认为在了解构成人体的细胞表型和人类基因组如何被用来构建和维持每个细胞的目标中，我们正处在一个迷人的旅程中。瑞士巴塞尔分子与临床眼科研究所
我国科学家实现单细胞表观组学新突破：两种革新单细胞ChIP-seq技术解码细胞命运决定机制
在国家重点研发计划“干细胞及转化”重点专项（批准号：2017YFA0103402）等资助下，北京大学分子医学研究所、北大-清华生命科学联合中心何爱彬课题组近期突破单细胞表观遗传研究的瓶颈，开发了两种具有普适性、操作简单、风格迥异的单细胞ChIP-seq技术，可适应于不同课题研究需要，解析发育与疾病状态下细胞命运决定调控机制。这两项技术分别于2019年8月27日在Molecular Cell和201
《Cell》重磅：北京大学张泽民课题组与勃林格殷格翰联合发表关于单细胞测序刻画肝癌免疫微环境动态特征的研究
北京大学生命科学学院、北京未来基因诊断高精尖创新中心（ICG）、生物医学前沿创新中心（BIOPIC）张泽民课题组、首都医科大学附属北京世纪坛医院彭吉润课题组以及德国药企勃林格殷格翰（Boehringer Ingelheim）公司肿瘤免疫与免疫调节部门多位科学家，在国际期刊Cell上发表了题为Landscape and Dynamics of Single Immune Cells in Hepat
Nat Commun：华人科学家利用新的单细胞遗传学方法解决潜在的耐药性问题
2019年10月23日讯 /生物谷BIOON /--圣母大学(University of Notre Dame)的研究人员利用一种可以识别单个细胞基因图谱的新技术，模拟了乳腺癌肿瘤对某种药物的潜在耐药性，然后确定了一种逆转这种耐药性的药物组合。图片来源：Nature CommunicationsSiyuan Zhang是圣母大学生物科学学院副教授，他和他的团队使用了一种新的分析方法，在《Natur
Nature：利用单细胞转录组学揭示成神经管细胞瘤不同亚型的细胞组成
2019年7月28日讯/生物谷BIOON/---成神经管细胞瘤（medulloblastoma）是一种恶性儿童小脑肿瘤类型，包含不同的分子亚型。成神经管细胞瘤已被分为四种不同的分子亚型：WNT和SHH（均由它们的同名基因发生的突变驱动），组3和组4。组3和组4占所有成神经管细胞瘤病例的60％，但是也最少被人理解的。这部分上是因为当前没有在遗传上准确地模拟组4的实验室模型。此外，尽管这些亚型的基因组
专注液滴微流控技术，万乘基因致力高通量单细胞多组学测序的应用普及
2001年2月12日，参与人类基因组计划的六国科学家公布了人类23对染色体DNA大规模测序的精确图谱。这是人类首次从分子视角探索生命的奥秘，而这项被称为生命科学“登月计划”的研究也成为推动精准医学发展的基础性力量。此后一段时期，包括华大基因在内的大批基因检测企业应运而生，他们输出了海量的人体微观数据。然而，随着人们对疾病认识不断深入，基于多细胞测序获得的数据已经不能满足一些复杂疾病诊断